RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	PTH1R	Q03431	593 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	DUSP28	Q4G0W2	176 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	RALYL	Q86SE5	291 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	CHMP4C	Q96CF2	233 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	MTMR8	Q96EF0	704 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	MAP3K14	Q99558	947 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	20.14	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	PALM3	A6NDB9	673 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424		E7EWF7	191 aa		20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	CTAGE5	O15320	804 aa		20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	ADCY6	O43306	1168 aa		20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	CDC37	Q16543	378 aa	Predicted RBP	20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	ANO2	Q9NQ90	1003 aa		20.13	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	ARVCF	O00192	962 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	CYB5R4	Q7L1T6	521 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO11	Q86XK2	927 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TMTC2	Q8N394	836 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC43A3	Q8NBI5	491 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LRCH3	Q96II8	777 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	IWS1	Q96ST2	819 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	JMJD4	Q9H9V9	463 aa		20.12	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	KLRF2	D3W0D1	207 aa		20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	IFIT3	O14879	490 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	SMPD1	P17405	629 aa		20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	MDM2	Q00987	491 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TLK2	Q86UE8	772 aa		20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LENG1	Q96BZ8	264 aa	Predicted RBP	20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	AMN	Q9BXJ7	453 aa		20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	MAD2L2	Q9UI95	211 aa		20.11	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	KPNA6	O60684	536 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	SMARCA1	P28370	1054 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	PDE4D	Q08499	809 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	FAAP100	Q0VG06	881 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	QRICH1	Q2TAL8	776 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	RNF20	Q5VTR2	975 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	NSUN6	Q8TEA1	469 aa	Known RBP	20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	SCFD2	Q8WU76	684 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	RIOX1	Q9H6W3	641 aa		20.1	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LTBP2	Q14767	1821 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	MYADML2	A6NDP7	307 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	ZBTB5	O15062	677 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	REC8	O95072	547 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	CALML3	P27482	149 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TROAP	Q12815	778 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	GRM4	Q14833	912 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	WTAP	Q15007	396 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	BRDT	Q58F21	947 aa	Predicted RBP	20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	IGDCC4	Q8TDY8	1250 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	POLR3E	Q9NVU0	708 aa		20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	RBM8A	Q9Y5S9	174 aa	Known RBP	20.09	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	20.08	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	CPT1A	P50416	773 aa		20.08	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	MB21D2	Q8IYB1	491 aa	Predicted RBP	20.08	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	20.08	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		20.08	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	TBX21	Q9UL17	535 aa		20.08	■□□□□ 0.81
HDAC10-216	ENST00000489424	LAMA3	Q16787	3333 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TIMP1	P01033	207 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	RAG1	P15918	1043 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	HSD17B4	P51659	736 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	USH1G	Q495M9	461 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CATIP	Q7Z7H3	387 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	STAG2	Q8N3U4	1231 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	BAD	Q92934	168 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM87B	Q96K49	555 aa		20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PRDM5	Q9NQX1	630 aa	Predicted RBP	20.07	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424		A6NJR5	290 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CD4	P01730	458 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	MCM5	P33992	734 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	LIFR	P42702	1097 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	NECTIN1	Q15223	517 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	STXBP2	Q15833	593 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	FAM126B	Q8IXS8	530 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	LZTS2	Q9BRK4	669 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	CPVL	Q9H3G5	476 aa		20.06	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	PNMA6F	A0A0J9YX94	578 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	DDAH1	O94760	285 aa		20.05	■□□□□ 0.8
HDAC10-216	ENST00000489424	KIF5B	P33176	963 aa		20.05	■□□□□ 0.8

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