RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487258.5

AKAP9-211, Transcript of A-kinase anchoring protein 9, humanhuman

TSL 2

Gene AKAP9, Length 3,983 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AKAP9-211ENST00000487258 VPS16Q9H269 839 aa11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 MYL1P05976 194 aa11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 POLR2MP0CAP2 368 aa11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CCDC125Q86Z20 511 aa11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SNED1Q8TER0 1413 aa11.13□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 WNT7AO00755 349 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 COBLO75128 1261 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 AP3B2Q13367 1082 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CCSER1Q9C0I3 900 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.12□□□□□ -0.637e-7■■□□□ 12.6
AKAP9-211ENST00000487258 VIL1P09327 827 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 RASA3Q14644 834 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ZNF341Q9BYN7 854 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 MYOZ2Q9NPC6 264 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 POTEMA6NI47 508 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 TBCAO75347 108 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 NPM3O75607 178 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 DPYDQ12882 1025 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 NPY5RQ15761 445 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CCDC144BQ3MJ40 725 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CCDC65Q8IXS2 484 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 IGSF22Q8N9C0 903 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KIAA1524Q8TCG1 905 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 LARP4BQ92615 738 aaKnown RBP11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 VPS33BQ9H267 617 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 STK17AQ9UEE5 414 aa11.12□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 UBXN1Q04323 297 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 FAM160B2Q86V87 743 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 HOMER2Q9NSB8 354 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SAMM50Q9Y512 469 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CHMP2AO43633 222 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KIF18AQ8NI77 898 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CCPG1Q9ULG6 757 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 GDAQ9Y2T3 454 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 PLIN4Q96Q06 1357 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 PRKG1Q13976 671 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SPDYE2Q495Y8 402 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KMT5BQ4FZB7 885 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CCDC40Q4G0X9 1142 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CEP135Q66GS9 1140 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SHISA4Q96DD7 197 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 PRIMPOLQ96LW4 560 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.11□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 MCM6Q14566 821 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ARID5BQ14865 1188 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 PTPN21Q16825 1174 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 MICALL2Q8IY33 904 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 A0A087X0B3 334 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ZBED4O75132 1171 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 FLOT1O75955 427 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ALAS1P13196 640 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ARHGAP4P98171 946 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 C7orf43Q8WVR3 580 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 RWDD2AQ9UIY3 292 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 PRR12Q9ULL5 1215 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KIAA1024Q9UPX6 916 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 DNM3Q9UQ16 869 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 STK24Q9Y6E0 443 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 IGKV6D-41A0A0C4DH26 115 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KCNJ18B7U540 433 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ECE1P42892 770 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 RAD51AP2Q09MP3 1159 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 KCNJ12Q14500 433 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 NBPF9Q3BBW0 867 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ZNF397Q8NF99 534 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 ACER1Q8TDN7 264 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 GMCL1Q96IK5 515 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 AS3MTQ9HBK9 375 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SLC39A2Q9NP94 309 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.1□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 MKL1Q969V6 931 aa11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SNHG28P0DPA3 235 aa11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 UBXN2AP68543 259 aa11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 SHROOM1Q2M3G4 852 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 TATDN1Q6P1N9 297 aa11.09□□□□□ -0.63
AKAP9-211ENST00000487258 NAV1Q8NEY1 1877 aa11.09□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.3 ms