RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484841.5

ACTB-212, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 1,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-212ENST00000484841 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 SNHG28P0DPA3 235 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 PDE4DQ08499 809 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 USH1GQ495M9 461 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 FAM126BQ8IXS8 530 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 MORC4Q8TE76 937 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 CTAGE5O15320 804 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 EPHB4P54760 987 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 ITGA7Q13683 1181 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 UBA5Q9GZZ9 404 aa23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.59■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 GUCD1Q96NT3 240 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 MYH6P13533 1939 aa23.58■■□□□ 1.37
ACTB-212ENST00000484841 RAD50Q92878 1312 aa23.58■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 CPT1AP50416 773 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 DNERQ8NFT8 737 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 ZSWIM5Q9P217 1185 aa23.57■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 DLL1O00548 723 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 TNKSO95271 1327 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 ABCB11O95342 1321 aa23.56■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 CD4P01730 458 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 TRDNQ13061 729 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 PPP2R5BQ15173 497 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 ANKS1AQ92625 1134 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 HIPK3Q9H422 1215 aa23.55■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 TMEM265A0A087WTH1 108 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.362e-12■□□□□ 9.3
ACTB-212ENST00000484841 MYL3P08590 195 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 CSF2RAP15509 400 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 TTC22Q5TAA0 569 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 RGS22Q8NE09 1264 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 SCFD2Q8WU76 684 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.54■■□□□ 1.362e-24■■□□□ 12.9
ACTB-212ENST00000484841 MAF1Q9H063 256 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 CPVLQ9H3G5 476 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.54■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 LAMA3Q16787 3333 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 PTGS1P23219 599 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 CYP2C18P33260 490 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 PSMC6P62333 389 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.53■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.52■■□□□ 1.36
ACTB-212ENST00000484841 KPNA6O60684 536 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 ACRP10323 421 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 TXNP10599 105 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 TTLL4Q14679 1199 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 TMEM240Q5SV17 173 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 FBXO11Q86XK2 927 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 IL23AQ9NPF7 189 aa23.51■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 ERICH2A1L162 156 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 B4GALT4O60513 344 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 ZNF365Q70YC5 407 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.5■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 FGBP02675 491 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 FOSL2P15408 326 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 EDNRBP24530 442 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 DNAJB2P25686 324 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 FAM47CQ5HY64 1035 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 MYLIPQ8WY64 445 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 GRIN2DO15399 1336 aa23.49■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 PDE4AP27815 886 aa23.48■■□□□ 1.35
ACTB-212ENST00000484841 CCL23P55773 120 aa23.48■■□□□ 1.35
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