RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484097.1

SH3BP4-209, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP4, Length 612 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-209ENST00000484097 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 RNF180Q86T96 592 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 DNERQ8NFT8 737 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 PIBF1Q8WXW3 757 aa22.36■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 CYTH3O43739 400 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 RXRAP19793 462 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC41Q15345 812 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 EEPD1Q7L9B9 569 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 FANCBQ8NB91 859 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 TBC1D5Q92609 795 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 SPZ1Q9BXG8 430 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 SPC25Q9HBM1 224 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 LCTP09848 1927 aa22.35■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 PGK1P00558 417 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 CFBP00751 764 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 COL6A1P12109 1028 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 PDE4DQ08499 809 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 MICU3Q86XE3 530 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 USP26Q9BXU7 913 aa22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP22.34■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 ASTN1O14525 1302 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 TNFAIP2Q03169 654 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC35G1Q2M3R5 365 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 IQSEC1Q6DN90 963 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 MORC4Q8TE76 937 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 KATNBL1Q9H079 304 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 VTA1Q9NP79 307 aa22.33■■□□□ 1.17
SH3BP4-209ENST00000484097 ZBTB43O43298 467 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CPA1P15085 419 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 APOA5Q6Q788 366 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 Q6ZUG5 572 aa22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.32■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PLEKHA8P1O95397 391 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CASTP20810 708 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ADCYAP1R1P41586 468 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CCDC82Q8N4S0 544 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.31■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RTN1Q16799 776 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ARHGEF16Q5VV41 709 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RMDN3Q96TC7 470 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 BRPF3Q9ULD4 1205 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa22.3■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 H0YGN5 161 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ADAMTS4O75173 837 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 POLR2MP0CAP2 368 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RPS6KB1P23443 525 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ATN1P54259 1190 aaPredicted RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 C7orf61Q8IZ16 206 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 FERMT2Q96AC1 680 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 IWS1Q96ST2 819 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 AP5M1Q9H0R1 490 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ALPK3Q96L96 1907 aa22.29■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGA8AA7E2F4 631 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 HSD17B4P51659 736 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GJA9P57773 515 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 LRRC26Q2I0M4 334 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 BRF1Q92994 677 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 COL20A1Q9P218 1284 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PHF24Q9UPV7 400 aa22.28■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 OPLAHO14841 1288 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 ADCY6O43306 1168 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SMPD1P17405 629 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 EDNRBP24530 442 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 APOBRQ0VD83 1088 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 PPP2R5BQ15173 497 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 STXBP2Q15833 593 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 KCNA10Q16322 511 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 GNASQ5JWF2 1037 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 SLC39A5Q6ZMH5 540 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 RUFY3Q7L099 469 aa22.27■■□□□ 1.16
SH3BP4-209ENST00000484097 KLHDC9Q8NEP7 349 aa22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.2 ms