RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482582.5

TRAIP-208, Transcript of TRAF interacting protein, human

TSL 5

Gene TRAIP, Length 820 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF236	Q9UL36	1845 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SLC15A5	A6NIM6	579 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	COBL	O75128	1261 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	DEXI	O95424	95 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PGK2	P07205	417 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FCER1A	P12319	257 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ADORA2A	P29274	412 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	GRB14	Q14449	540 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	KIF22	Q14807	665 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	NSMF	Q6X4W1	530 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	HSCB	Q8IWL3	235 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	MMP19	Q99542	508 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	VPS54	Q9P1Q0	977 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FBXO40	Q9UH90	709 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PNMA2	Q9UL42	364 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	DNAJC25-GNG10	A0A024R161	153 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	STRN	O43815	780 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FOSB	P53539	338 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	NAPA	P54920	295 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CNTN2	Q02246	1040 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PRKCZ	Q05513	592 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	UBE2Q1	Q7Z7E8	422 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ANKRD35	Q8N283	1001 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ALG1	Q9BT22	464 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FOXD4L1	Q9NU39	408 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	COL20A1	Q9P218	1284 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SRRD	Q9UH36	339 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	IVNS1ABP	Q9Y6Y0	642 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SMCO2	A6NFE2	343 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	MEIS2	O14770	477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CFB	P00751	764 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CCL5	P13501	91 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	HOXA13	P31271	388 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FLT3LG	P49771	235 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	HSD17B4	P51659	736 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	RPS6	P62753	249 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	GHRHR	Q02643	423 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	TRAF1	Q13077	416 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	KCTD2	Q14681	263 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	NPY5R	Q15761	445 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ABRA	Q8N0Z2	381 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	RGS22	Q8NE09	1264 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	NPLOC4	Q8TAT6	608 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	DPF3	Q92784	378 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FGD4	Q96M96	766 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	UNC93B1	Q9H1C4	597 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	KCNJ14	Q9UNX9	436 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ASTN1	O14525	1302 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	hCG_1984214	I3L0E3	225 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CYP2B6	P20813	491 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CALML3	P27482	149 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	GJB2	P29033	226 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	HMGN5	P82970	282 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	MAP2K5	Q13163	448 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	UBE2S	Q16763	222 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF792	Q3KQV3	632 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PPP1R18	Q6NYC8	613 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ZNF713	Q8N859	430 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FAM133A	Q8N9E0	248 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SYTL5	Q8TDW5	730 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	NUDT12	Q9BQG2	462 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ZMYND12	Q9H0C1	365 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PRO3102	Q9H379	93 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SH3GLB2	Q9NR46	395 aa		13.55	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	MYH7B	A7E2Y1	1941 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ESYT2	A0FGR8	921 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	POTEB2	H3BUK9	544 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SOX1	O00570	391 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	POLR2M	P0CAP2	368 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ELN	P15502	786 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	GRK4	P32298	578 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CCL14	Q16627	93 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	DPP9	Q86TI2	863 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	TAAR1	Q96RJ0	339 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PHF20	Q9BVI0	1012 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	TMEM260	Q9NX78	707 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	FLRT1	Q9NZU1	646 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	SMC3	Q9UQE7	1217 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ZSCAN21	Q9Y5A6	473 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PFAS	O15067	1338 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	PIK3CD	O00329	1044 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	GNRH1	P01148	92 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	HOXC6	P09630	235 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	HOXD10	P28358	340 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	CLK2	P49760	499 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TRAIP-208	ENST00000482582	ADCY7	P51828	1080 aa		13.53	□□□□□ -0.24

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