RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480940.1

PHF20-210, Transcript of PHD finger protein 20, humanhuman

TSL 2

Gene PHF20, Length 643 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF20-210ENST00000480940 GALNT18Q6P9A2 607 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 ZSWIM9Q86XI8 627 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 JAMLQ86YT9 394 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 THAP3Q8WTV1 239 aaPredicted RBP5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 ASIC4Q96FT7 647 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 MMP19Q99542 508 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 KANSL2Q9H9L4 492 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 GPR160Q9UJ42 338 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 ACSL6Q9UKU0 697 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 TAF6LQ9Y6J9 622 aa5.87□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 C7orf72A4D263 438 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 IQCJ-SCHIP1C9J366 451 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 MSL3P1P0C860 447 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 PRKCAP17252 672 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 L1CAMP32004 1257 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 SQSTM1Q13501 440 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 SNX17Q15036 470 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 NTRK3Q16288 839 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 C2orf27AQ580R0 203 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 TMEM67Q5HYA8 995 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 MCTP1Q6DN14 999 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 SCUBE1Q8IWY4 988 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 PPIL6Q8IXY8 311 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 FAM168AQ92567 244 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 YBX2Q9Y2T7 364 aaKnown RBP5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa5.86□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 BLACEA4D250 179 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 GLI1P08151 1106 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 LCP1P13796 627 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 KCNAB2Q13303 367 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 NOP9Q86U38 636 aaKnown RBP5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 SIRT2Q8IXJ6 389 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 NUP43Q8NFH3 380 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 DPF3Q92784 378 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 DIO2Q92813 273 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 SLC26A8Q96RN1 970 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 CDC6Q99741 560 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP5.85□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 LTBRP36941 435 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 IQCEQ6IPM2 695 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 USP53Q70EK8 1073 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 JAZF1Q86VZ6 243 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 ZSWIM2Q8NEG5 633 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 NLGN2Q8NFZ4 835 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 LIN37Q96GY3 246 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 DHRS4Q9BTZ2 278 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 CRTAC1Q9NQ79 661 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 GULP1Q9UBP9 304 aa5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 MRPS23Q9Y3D9 190 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
PHF20-210ENST00000480940 NPHS1O60500 1241 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 PNLIPP16233 465 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 CORO7P57737 925 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 CYP4F8P98187 520 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 GIMAP6Q6P9H5 292 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 KCNT2Q6UVM3 1135 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 RCBTB1Q8NDN9 531 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 INTS4Q96HW7 963 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 MTA3Q9BTC8 594 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 PHF20Q9BVI0 1012 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 PDLIM7Q9NR12 457 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 FAM120AQ9NZB2 1118 aaKnown RBP eCLIP5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 FBLN5Q9UBX5 448 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 RWDD3Q9Y3V2 267 aa5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 MSCO60682 206 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 SDHBP21912 280 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 TACR1P25103 407 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 LZTR1Q8N653 840 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 DCAF4Q8WV16 495 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 GPR27Q9NS67 375 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 FBXL7Q9UJT9 491 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 TBX22Q9Y458 520 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 TIMM13Q9Y5L4 95 aaPredicted RBP5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 ASXL2Q76L83 1435 aa5.82□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 A0A1W2PQ27 194 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 A0A1W2PQ64 194 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 A0A1W2PQC6 194 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 A0A1W2PQD8 194 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 ESYT3A0FGR9 886 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 BCL6P41182 706 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 ERVFRD-1P60508 538 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 RPL11P62913 178 aaKnown RBP5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 STYK1Q6J9G0 422 aa5.81□□□□□ -1.48
PHF20-210ENST00000480940 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.5 ms