RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478932.1

USP25-208, Transcript of ubiquitin specific peptidase 25, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene USP25, Length 2,605 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP25-208ENST00000478932 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 UBASH3AP57075 661 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FANCCQ00597 558 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 RASSF7Q02833 373 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 RRAGBQ5VZM2 374 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC125Q86Z20 511 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CREBRFQ8IUR6 639 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ELOA2Q8IYF1 753 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 AGBL3Q8NEM8 1001 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KIAA1524Q8TCG1 905 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CUL5Q93034 780 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MTMR8Q96EF0 704 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KIF12Q96FN5 646 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MRFAP1L1Q96HT8 127 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GSDMAQ96QA5 445 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 RIC8AQ9NPQ8 531 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 DISC1Q9NRI5 854 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FBXO28Q9NVF7 368 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FZD1Q9UP38 647 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MYH8P13535 1937 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FOCADQ5VW36 1801 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MEIS2O14770 477 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 BMP3P12645 472 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CAP2P40123 477 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TXLNAP40222 546 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 DGKZQ13574 1117 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CALCRLQ16602 461 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FAM83BQ5T0W9 1011 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 LRRC8AQ8IWT6 810 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MICALL2Q8IY33 904 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CYP2W1Q8TAV3 490 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TBC1D5Q92609 795 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CCDC34Q96HJ3 373 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MTMR9Q96QG7 549 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 NUDT12Q9BQG2 462 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CNOT7Q9UIV1 285 aaKnown RBP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PRR12Q9ULL5 1215 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TMX2Q9Y320 296 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MORC2Q9Y6X9 1032 aaPredicted RBP4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MYH4Q9Y623 1939 aa4.66□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 LAD1O00515 517 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 OPLAHO14841 1288 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 MARCH6O60337 910 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SKILP12757 684 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PLCG1P19174 1290 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PTGER2P43116 358 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 CLK2P49760 499 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 STAT2P52630 851 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 TNIP1Q15025 636 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FCHSD1Q86WN1 690 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 FBXO11Q86XK2 927 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 IGSF22Q8N9C0 903 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GMCL1P1Q8NEA9 526 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 DCAF4Q8WV16 495 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 HAS1Q92839 578 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 KIFC2Q96AC6 838 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GMCL1Q96IK5 515 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 SGIP1Q9BQI5 828 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 AMNQ9BXJ7 453 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 DEFB129Q9H1M3 183 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 VPS33BQ9H267 617 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 LRWD1Q9UFC0 647 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 PCDHA12Q9UN75 941 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 GDAQ9Y2T3 454 aa4.65□□□□□ -1.66
USP25-208ENST00000478932 QSER1Q2KHR3 1735 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 LOC100996750A0A140TA64 210 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 hCG_1984214I3L0E3 225 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 OFD1O75665 1012 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 CFBP00751 764 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 RPN1P04843 607 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 PRPHP41219 470 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 TPM4P67936 248 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 GOLGA8FQ08AF8 430 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 PRR16Q569H4 304 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 SYDE2Q5VT97 1194 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 FKBP1CQ5VVH2 108 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 CCDC174Q6PII3 467 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 SLC30A10Q6XR72 485 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 TMC6Q7Z403 805 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 FAM83AQ86UY5 434 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 CABP7Q86V35 215 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 TRIML1Q8N9V2 468 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 HPS3Q969F9 1004 aa4.65□□□□□ -1.67
USP25-208ENST00000478932 OTUD5Q96G74 571 aa4.65□□□□□ -1.67
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.5 ms