RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000478490.5

MITF-215, Transcript of melanogenesis associated transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene MITF, Length 1,642 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MITF-215ENST00000478490 STAT3P40763 770 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 HAND2P61296 217 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PDE4BQ07343 736 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 LRRC26Q2I0M4 334 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SLFN13Q68D06 897 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ZNF589Q86UQ0 364 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MB21D1Q8N884 522 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 ANKLE1Q8NAG6 615 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SHCBP1Q8NEM2 672 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 REPS2Q8NFH8 660 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 UPF3BQ9BZI7 483 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 IL25Q9H293 177 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MROH8Q9H579 483 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TOMM22Q9NS69 142 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 PDRG1Q9NUG6 133 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MTMR4Q9NYA4 1195 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 NYAP2Q9P242 653 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RIPK3Q9Y572 518 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 MYH7BA7E2Y1 1941 aa7.28□□□□□ -1.24
MITF-215ENST00000478490 TMEM232C9JQI7 657 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 STRNO43815 780 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 HOXC6P09630 235 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CYBAP13498 195 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 NCLP19338 710 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CASTP20810 708 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CREB3L3Q68CJ9 461 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MCTP1Q6DN14 999 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 KCTD1Q719H9 257 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 RUFY3Q7L099 469 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 RIOX2Q8IUF8 465 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 NEDD1Q8NHV4 660 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MAML3Q96JK9 1138 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 HELLSQ9NRZ9 838 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 HOMER2Q9NSB8 354 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DDX20Q9UHI6 824 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 LRRC37A2A6NM11 1700 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 BAZ2BQ9UIF8 2168 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 COL6A3P12111 3177 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TSPY2A6NKD2 308 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZBED4O75132 1171 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SLC25A27O95847 323 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TTLL1O95922 423 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 AK2P54819 239 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PTH1RQ03431 593 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CCDC174Q6PII3 467 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 FERMT2Q96AC1 680 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ARID3AQ99856 593 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZNF287Q9HBT7 754 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 IL17RBQ9NRM6 502 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 LMBRD1Q9NUN5 540 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 STX8Q9UNK0 236 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SMC3Q9UQE7 1217 aa7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP7.27□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SLC27A2O14975 620 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 IGHA2P01877 340 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 FGAP02671 866 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 COL6A1P12109 1028 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 BMP3P12645 472 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PDCP20941 246 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZNF445P59923 1031 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 KCTD2Q14681 263 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZNF792Q3KQV3 632 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 OLFML2BQ68BL8 750 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ANP32BQ92688 251 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MKL1Q969V6 931 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZMYND15Q9H091 742 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 GRPEL1Q9HAV7 217 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ZDHHC9Q9Y397 364 aa7.26□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PLIN4Q96Q06 1357 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 PGK1P00558 417 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 HSPD1P10809 573 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 SLC16A2P36021 539 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 ADCYAP1R1P41586 468 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 CCDC96Q2M329 555 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TTBK2Q6IQ55 1244 aa7.25□□□□□ -1.25
MITF-215ENST00000478490 TBC1D10CQ8IV04 446 aa7.25□□□□□ -1.25
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