RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000472943.5

LINC00886-201, long intergenic non-protein coding RNA 886, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene LINC00886, Length 3,306 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00886-201ENST00000472943 KAT2BQ92831 832 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 DRC1Q96MC2 740 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SMARCAL1Q9NZC9 954 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PCDHA6Q9UN73 950 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 EBAG9O00559 213 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 LCA5LO95447 670 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 EPHB4P54760 987 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 GNGT1P63211 74 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 FAM114A1Q8IWE2 563 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SUGP1Q8IWZ8 645 aaKnown RBP11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 TRIM9Q9C026 710 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 YY1AP1Q9H869 796 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 EHD2Q9NZN4 543 aa11.52□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 EPHB6O15197 1021 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 USO1O60763 962 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 FCER1AP12319 257 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PLCG1P19174 1290 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 KIF11P52732 1056 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PDE4DQ08499 809 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 INF2Q27J81 1249 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 ARL8AQ96BM9 186 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 RABEP2Q9H5N1 569 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 STIM2Q9P246 746 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 ERLIN2O94905 339 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CYP2D6P10635 497 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CXCR5P32302 372 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 LIG3P49916 1009 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 TTC19Q6DKK2 380 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 EMBQ6PCB8 327 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 MMS22LQ6ZRQ5 1243 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 C2CD5Q86YS7 1000 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CAVIN3Q969G5 261 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 DCP1AQ9NPI6 582 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SIK3Q9Y2K2 1263 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa11.51□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 OPA1O60313 960 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 NTSR2O95665 410 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 TNFRSF8P28908 595 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 KIF5BP33176 963 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SKOR1P84550 965 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC178Q5BJE1 867 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PSMB7Q99436 277 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CUEDC2Q9H467 287 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SALL4Q9UJQ4 1053 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 HYOU1Q9Y4L1 999 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 TCP1P17987 556 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PRPHP41219 470 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 ALS2CLQ60I27 953 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 C7orf25Q9BPX7 421 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 MAGEF1Q9HAY2 307 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SHTN1A0MZ66 631 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 LAD1O00515 517 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 NCK2O43639 380 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SLC35G1Q2M3R5 365 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CABP7Q86V35 215 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 DAGLBQ8NCG7 672 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 KIAA0895Q8NCT3 520 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 IQCDQ96DY2 449 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SEMA6BQ9H3T3 888 aa11.5□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 MAST2Q6P0Q8 1798 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 TSPY2A6NKD2 308 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 TXNRD1Q16881 649 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 HPS3Q969F9 1004 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 ASIC1P78348 528 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 COBLL1Q53SF7 1204 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 ZIM3Q96PE6 472 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 ALS2CR12Q96Q35 445 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 TLR10Q9BXR5 811 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 FAM207AQ9NSI2 230 aaPredicted RBP11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 DOT1LQ8TEK3 1739 aa11.49□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PJA2O43164 708 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 HSF2BPO75031 334 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 VWA3BQ502W6 1294 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CCDC181Q5TID7 509 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 IL17RBQ9NRM6 502 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 MAD2L2Q9UI95 211 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 SAMM50Q9Y512 469 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 LRRC53A6NM62 1247 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CAMTA2O94983 1202 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PPP1R2P41236 205 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 MECOMQ03112 1051 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PDCLQ13371 301 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 UBE4AQ14139 1066 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PARP10Q53GL7 1025 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 CENPPQ6IPU0 288 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 C8orf74Q6P047 294 aa11.48□□□□□ -0.57
LINC00886-201ENST00000472943 PNMA1Q8ND90 353 aa11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.6 ms