RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462363.6

PTPRC-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PTPRC, Length 926 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-210ENST00000462363 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PDILTQ8N807 584 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 AGBL3Q8NEM8 1001 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 FAM151AQ8WW52 585 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 DPF2Q92785 391 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 SMARCE1Q969G3 411 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 DHX58Q96C10 678 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 AK8Q96MA6 479 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 XPO4Q9C0E2 1151 aaKnown RBP6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 C6orf50Q9HD87 102 aa6.41□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM260Q9NX78 707 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PP2D1A8MPX8 630 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 BECN2A8MW95 431 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 SLC37A4O43826 429 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 PLA2G6O60733 806 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 MSNP26038 577 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 CASP1P29466 404 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ADCY7P51828 1080 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 TCP10Q12799 353 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 KCNB1Q14721 858 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ARID5BQ14865 1188 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 QRICH1Q2TAL8 776 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 HYIQ5T013 277 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 PPP4R3AQ6IN85 833 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 ARMCX5Q6P1M9 558 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 TMEM139Q8IV31 216 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 HAS1Q92839 578 aa6.4□□□□□ -1.38
PTPRC-210ENST00000462363 COA7Q96BR5 231 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.4□□□□□ -1.38
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PTPRC-210ENST00000462363 F5H6K3 240 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 MEIS2O14770 477 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 NEMFO60524 1076 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RAD17O75943 681 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 RHOBTB3O94955 611 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 SMC2O95347 1197 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TDP2O95551 362 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 GHRHRQ02643 423 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 ICA1Q05084 483 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 KLRC3Q07444 240 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 EHHADHQ08426 723 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 MOXD1Q6UVY6 613 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 KCTD1Q719H9 257 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 HOMER1Q86YM7 354 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 IRF2BP1Q8IU81 584 aa6.39□□□□□ -1.39
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PTPRC-210ENST00000462363 TMC2Q8TDI7 906 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 LENG9Q96B70 501 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRC-210ENST00000462363 TEPSINQ96N21 525 aa6.39□□□□□ -1.39
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