RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461017.1

RABGEF1-206, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 3

Gene RABGEF1, Length 711 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-206ENST00000461017 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 RIOX1Q9H6W3 641 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 PDGFCQ9NRA1 345 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 COL20A1Q9P218 1284 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 SNX14Q9Y5W7 946 aa8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 TRIP12Q14669 1992 aaPredicted RBP8.19□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 CEP290O15078 2479 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 MYADML2A6NDP7 307 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 KLRF2D3W0D1 207 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 SEPT4O43236 478 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 PLEKHA8P1O95397 391 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 ACVR2BQ13705 512 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 TAPT1Q6NXT6 567 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 ARMCX2Q7L311 632 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 ZNF654Q8IZM8 581 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 NEK1Q96PY6 1258 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 PIGSQ96S52 555 aa8.18□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 CTAGE5O15320 804 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 PGK1P00558 417 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 MCM5P33992 734 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 HSPA4P34932 840 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 NUP133Q8WUM0 1156 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 PIBF1Q8WXW3 757 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 DPF3Q92784 378 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 C11orf49Q9H6J7 331 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 SCUBE2Q9NQ36 999 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 SLC5A4Q9NY91 659 aa8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 ZHX1Q9UKY1 873 aaPredicted RBP8.17□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.17□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 PTPDC1A2A3K4 754 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 H0YGN5 161 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 CALML3P27482 149 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 LIFRP42702 1097 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC144BQ3MJ40 725 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 HOMER1Q86YM7 354 aa8.16□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 KLHDC9Q8NEP7 349 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 SENP6Q9GZR1 1112 aaPredicted RBP8.16□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 ARIH2O95376 493 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 AKR1A1P14550 325 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 FUT2Q10981 343 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 RNF207Q6ZRF8 634 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 SGMS1Q86VZ5 419 aa8.15□□□□□ -1.1
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RABGEF1-206ENST00000461017 MTA3Q9BTC8 594 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 NRBP1Q9UHY1 535 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 FAM184BQ9ULE4 1060 aa8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.1
RABGEF1-206ENST00000461017 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 WDR81Q562E7 1941 aa8.15□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.14□□□□□ -1.11
RABGEF1-206ENST00000461017 CCDC69A6NI79 296 aa8.14□□□□□ -1.11
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