RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460801.5

PTPRN-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRN, Length 2,239 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-210ENST00000460801 SPAG1Q07617 926 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 GRB10Q13322 594 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 TMEM266Q2M3C6 531 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 FILIP1LQ4L180 1135 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 FCHSD1Q86WN1 690 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 HERC5Q9UII4 1024 aaKnown RBP15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa15.66■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 PSMD14O00487 310 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 ARHGAP6O43182 974 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 NDUFB10O96000 172 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 GH2P01242 217 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 DPEP1P16444 411 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 AMPD3Q01432 767 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 KRT31Q15323 416 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 RAB34Q9BZG1 259 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 TMOD2Q9NZR1 351 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 STK17AQ9UEE5 414 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 COL4A5P29400 1685 aa15.65■□□□□ 0.1
PTPRN-210ENST00000460801 STX10O60499 249 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 RAD17O75943 681 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 ADKP55263 362 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 LARGE2Q8N3Y3 721 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 HAS1Q92839 578 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 PNMA5Q96PV4 448 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 VPS33BQ9H267 617 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CCP110O43303 1012 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CTIFO43310 598 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 BAG6P46379 1132 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 STIM1Q13586 685 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 TCP11X2Q5H9J9 407 aa15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP15.64■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 ITIH6Q6UXX5 1313 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 TCP10L2B9ZVM9 353 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L15C9J2P7 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L13C9JLJ4 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L11C9JVI0 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L18D6R9N7 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L22D6RA61 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L17D6RBQ6 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L19D6RCP7 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L20D6RJB6 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 PSMA7O14818 248 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L24Q0WX57 530 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 DLGAP5Q15398 846 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP17L6PQ6QN14 398 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 BTNL9Q6UXG8 535 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 DEFB132Q7Z7B7 95 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 IRF2BP1Q8IU81 584 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 SLC16A10Q8TF71 515 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 FAM151AQ8WW52 585 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 NUP88Q99567 741 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 HDAC9Q9UKV0 1011 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 A0A1W2PRG0 241 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 POTEMA6NI47 508 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 KCNJ18B7U540 433 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 TUBB4AP04350 444 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 USP11P51784 963 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 COPB1P53618 953 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 PMS1P54277 932 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 KCNJ12Q14500 433 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 SV2BQ7L1I2 683 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 ZNF592Q92610 1267 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 PANX2Q96RD6 677 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 AMNQ9BXJ7 453 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CLRN2A0PK11 232 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 TRIM49BA6NDI0 452 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 MEIS2O14770 477 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 BMP3P12645 472 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 ASIC1P78348 528 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 PDE4DQ08499 809 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 COBLL1Q53SF7 1204 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 SYDE2Q5VT97 1194 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 KRT79Q5XKE5 535 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 OGFOD1Q8N543 542 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 EXOC1Q9NV70 894 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 KIF13BQ9NQT8 1826 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CNTNAP1P78357 1384 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 N4BP3O15049 544 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CYP3A7P24462 503 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 RBL2Q08999 1139 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 AP3B2Q13367 1082 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 SPDYE2Q495Y8 402 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRN-210ENST00000460801 TMEM119Q4V9L6 283 aa15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.9 ms