RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460605.1

GTPBP1-204, Transcript of GTP binding protein 1, human

TSL 3

Gene GTPBP1, Length 581 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
GTPBP1-204	ENST00000460605	GREB1L	Q9C091	1923 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	EPOP	A6NHQ4	379 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	TMEM232	C9JQI7	657 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	NKRF	O15226	690 aa	Known RBP eCLIP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	PLA2G6	O60733	806 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC3A2	P08195	630 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	ALAS1	P13196	640 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	GNAT2	P19087	354 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	MRE11	P49959	708 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	PURA	Q00577	322 aa	Known RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	LEXM	Q3ZCV2	418 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	KRT40	Q6A162	431 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	VWCE	Q96DN2	955 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	CEP95	Q96GE4	821 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	WDR11	Q9BZH6	1224 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	MYH4	Q9Y623	1939 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZNF536	O15090	1300 aa		12.86	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	IGKV6D-41	A0A0C4DH26	115 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	EFCAB14	O75071	495 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	MYL3	P08590	195 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLC1A4	P43007	532 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	PDE4B	Q07343	736 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	FAM178B	Q8IXR5	827 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	CAGE1	Q8TC20	777 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	MORC4	Q8TE76	937 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	GMCL1	Q96IK5	515 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	STRBP	Q96SI9	672 aa	Known RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	UBE2Z	Q9H832	354 aa	Predicted RBP	12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		12.85	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	PPAN-P2RY11	A0A0B4J1V8	794 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605		B4DLN1	442 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	LPXN	O60711	386 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	TSPY3	P0CV98	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	TSPY8	P0CW00	308 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	NBPF20	Q3BBV1	942 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	STK11IP	Q8N1F8	1099 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	LRRC47	Q8N1G4	583 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	OR6J1	Q8NGC5	347 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	AFAP1L1	Q8TED9	768 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	TGS1	Q96RS0	853 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	CRBN	Q96SW2	442 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	RAD9A	Q99638	391 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	PUS7L	Q9H0K6	701 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	BCL11A	Q9H165	835 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	PNMA2	Q9UL42	364 aa		12.84	□□□□□ -0.35
GTPBP1-204	ENST00000460605	MS4A1	P11836	297 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	TDO2	P48775	406 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	NSMF	Q6X4W1	530 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	SNX27	Q96L92	541 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	NACAP1	Q9BZK3	213 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	MYH7	P12883	1935 aa		12.83	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	ABHD14A-ACY1	A0A1B0GW23	586 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	DCX	O43602	365 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	APP	P05067	770 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	KCNA5	P22460	613 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	ERVK-21	P61565	698 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	WDR5	P61964	334 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	NHLH1	Q02575	133 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PPP2R5B	Q15173	497 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PTPRO	Q16827	1216 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PTCRA	Q6ISU1	281 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	RCSD1	Q6JBY9	416 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	CNKSR3	Q6P9H4	555 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	NEDD1	Q8NHV4	660 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	UPF3B	Q9BZI7	483 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	CHMP4B	Q9H444	224 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	CD320	Q9NPF0	282 aa		12.82	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PLIN4	Q96Q06	1357 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	SCN5A	Q14524	2016 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	RBM47	A0AV96	593 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605		A6NJR5	290 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	ICAM1	P05362	532 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	ZFY	P08048	801 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PTGIS	Q16647	500 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	GDPD5	Q8WTR4	605 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	SCFD2	Q8WU76	684 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	MFSD14A	Q96MC6	490 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	SUGCT	Q9HAC7	445 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRKAG3	Q9UGI9	489 aa		12.81	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	TANC1	Q9C0D5	1861 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PRDM1	O75626	825 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	ARHGEF15	O94989	841 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	GJB5	O95377	273 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	RLBP1	P12271	317 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	SELP	P16109	830 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	MCC	P23508	829 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	TFAP4	Q01664	338 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	PDE4D	Q08499	809 aa		12.8	□□□□□ -0.36
GTPBP1-204	ENST00000460605	IKBKE	Q14164	716 aa		12.8	□□□□□ -0.36

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37.4 ms