RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435142.1

USP9YP28-201, Transcript of USP9Y pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene USP9YP28, Length 589 nt, Biotype unprocessed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9YP28-201ENST00000435142 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 CABP7Q86V35 215 aa7.37□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SH3RF3Q8TEJ3 882 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 MENTQ9BUN1 341 aa7.37□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SMAD4Q13485 552 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SLC9A5Q14940 896 aa7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 RGL3Q3MIN7 710 aa7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SPRED1Q7Z699 444 aa7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 PEX11GQ96HA9 241 aa7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 GP6Q9HCN6 339 aa7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 INVSQ9Y283 1065 aa7.36□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SLPIP03973 132 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 IFNGR1P15260 489 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 PMS1P54277 932 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 APOBRQ0VD83 1088 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 DCAF15Q66K64 600 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 LGI4Q8N135 537 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 Q8N1X5 172 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 LINC00482Q8N8I6 264 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 DDX11Q96FC9 970 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SSBP3Q9BWW4 388 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 NUDT5Q9UKK9 219 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 FHOD1Q9Y613 1164 aa7.35□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF536O15090 1300 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 CYR61O00622 381 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 ACRP10323 421 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 ACVRL1P37023 503 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 POU4F1Q01851 419 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 TDRD10Q5VZ19 366 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 GLB1LQ6UWU2 654 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 FBXO33Q7Z6M2 555 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 FIBCD1Q8N539 461 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 SF3B6Q9Y3B4 125 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
USP9YP28-201ENST00000435142 ZBTB7AO95365 584 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 CD3EP07766 207 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 CD247P20963 164 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 ITGAEP38570 1179 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM124AQ86V42 546 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 LZTR1Q8N653 840 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 NETO2Q8NC67 525 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 NKD1Q969G9 470 aa7.33□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 BORAQ6PGQ7 559 aa7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 LIMS2Q7Z4I7 341 aa7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 PPFIBP1Q86W92 1011 aa7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 SLITRK4Q8IW52 837 aa7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 FBLN5Q9UBX5 448 aa7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 RWDD3Q9Y3V2 267 aa7.32□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 MROH6A6NGR9 719 aa7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 CYP2C8P10632 490 aa7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 RPL13P26373 211 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 TAGLNQ01995 201 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 CRIP3Q6Q6R5 217 aa7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 GORASP1Q9BQQ3 440 aa7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 NOL6Q9H6R4 1146 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 TSC22D4Q9Y3Q8 395 aa7.31□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 TP53P04637 393 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM26FQ5R3K3 315 aa7.3□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 ZDHHC15Q96MV8 337 aa7.3□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 GGT7Q9UJ14 662 aa7.3□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF451Q9Y4E5 1061 aa7.3□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 FZD7O75084 574 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 ITGA4P13612 1032 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 THBS2P35442 1172 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 CDSNQ15517 529 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 EEF1DP3Q658K8 133 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 MCTP2Q6DN12 878 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 RCSD1Q6JBY9 416 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 USP51Q70EK9 711 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 PCDH18Q9HCL0 1135 aa7.29□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 A0A087WZG4 1122 aa7.28□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 C8BP07358 591 aa7.28□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP7.28□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 KYQ8NBH2 561 aa7.28□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 MTA3Q9BTC8 594 aa7.28□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 FAM86C1Q9NVL1 165 aa7.28□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
USP9YP28-201ENST00000435142 TXNDC5Q8NBS9 432 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 USP33Q8TEY7 942 aa7.27□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 SYT3Q9BQG1 590 aa7.27□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 ZNF747Q9BV97 191 aa7.27□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 PPP2R5DQ14738 602 aa7.26□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 TCEAL1Q15170 157 aa7.26□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 WWC2Q6AWC2 1192 aa7.26□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 HS2ST1Q7LGA3 356 aa7.26□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
USP9YP28-201ENST00000435142 CDK5RAP1Q96SZ6 601 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.1 ms