RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435088.1

RPS15AP28-201, Transcript of ribosomal protein S15a pseudogene 28, humanhuman

BASIC

Gene RPS15AP28, Length 386 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS15AP28-201ENST00000435088 UPK3BL1B0FP48 263 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 UPK3BL2E5RIL1 263 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 EXOC5O00471 708 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CHL1O00533 1208 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ACRP10323 421 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PLCG1P19174 1290 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 GIPRP48546 466 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ZNF165P49910 485 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RARSP54136 660 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ETF1P62495 437 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 NFKBIBQ15653 356 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CPSF6Q16630 551 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 MSMPQ1L6U9 139 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 OVOS1Q6IE37 1185 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PAOXQ6QHF9 649 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 MCF2L2Q86YR7 1114 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 WFDC3Q8IUB2 231 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PHF6Q8IWS0 365 aaKnown RBP eCLIP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 IFNL2Q8IZJ0 200 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 TAB3Q8N5C8 712 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 FAM169BQ8N8A8 192 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 MFSD2AQ8NA29 543 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 EXOC6Q8TAG9 804 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RIN3Q8TB24 985 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SHKBP1Q8TBC3 707 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PANK1Q8TE04 598 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 TMEM40Q8WWA1 233 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SSH1Q8WYL5 1049 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ATG4CQ96DT6 458 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 MFSD14AQ96MC6 490 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 TBC1D32Q96NH3 1257 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CRBNQ96SW2 442 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 KCNF1Q9H3M0 494 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ANTXR1Q9H6X2 564 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CCSER2Q9H7U1 834 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CNNM2Q9H8M5 875 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PRDM10Q9NQV6 1147 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SMC4Q9NTJ3 1288 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 GMIPQ9P107 970 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 EFR3BQ9Y2G0 817 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 LTN1O94822 1766 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa2.99□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 LMO7Q8WWI1 1683 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SPATA31A5Q5VU36 1347 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SPATA31A7Q8IWB4 1347 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 BCL9LQ86UU0 1499 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 COL18A1P39060 1754 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RGS13O14921 159 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RNGTTO60942 597 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 VAMP4O75379 141 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 UBOX5O94941 541 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ANXA1P04083 346 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 FAM87AP0C7U9 286 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 NME1P15531 152 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RXRBP28702 533 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 NASPP49321 788 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 VPS72Q15906 364 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 DDB1Q16531 1140 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 NAALADL2Q58DX5 795 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 GK5Q6ZS86 529 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ZNF765Q7L2R6 523 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 G2E3Q7L622 706 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CYB5D2Q8WUJ1 264 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 DPH2Q9BQC3 489 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 TNKS2Q9H2K2 1166 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SEMA6BQ9H3T3 888 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SLC52A2Q9HAB3 445 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CAPN10Q9HC96 672 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 TMOD3Q9NYL9 352 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 STRIP2Q9ULQ0 834 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RNF112Q9ULX5 631 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 PPT2Q9UMR5 302 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 KDM6AO15550 1401 aaPredicted RBP2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 NCAPD2Q15021 1401 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 ABCA3Q99758 1704 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 SLIT2O94813 1529 aa2.98□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RGPD2P0DJD1 1756 aa2.97□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP2.97□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 RNF123Q5XPI4 1314 aa2.97□□□□□ -1.93
RPS15AP28-201ENST00000435088 DISP2A7MBM2 1401 aa2.97□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.5 ms