RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000434333.1

HLA-B-250, Transcript of major histocompatibility complex, class I, B, humanhuman

Gene HLA-B, Length 863 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-B-250ENST00000434333 CALML3P27482 149 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 RNF207Q6ZRF8 634 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 SLC43A3Q8NBI5 491 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 VTI1AQ96AJ9 217 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CTNNA3Q9UI47 895 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 TNKSO95271 1327 aa23.57■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 EDNRBP24530 442 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 FPGSQ05932 587 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 GUCD1Q96NT3 240 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 KAT14Q9H8E8 782 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 GRIN2DO15399 1336 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 RAD50Q92878 1312 aa23.56■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CD4P01730 458 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 KRT23Q9C075 422 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.55■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CABYRO75952 493 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 SMAD3P84022 425 aaKnown RBP23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 USH1GQ495M9 461 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 ASPRV1Q53RT3 343 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 MFSD5Q6N075 450 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 ADGRF4Q8IZF3 695 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CNNM2Q9H8M5 875 aa23.54■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 SEC23AQ15436 765 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CYB5R4Q7L1T6 521 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 RGS22Q8NE09 1264 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 DNERQ8NFT8 737 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 FAM161BQ96MY7 647 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CDH23Q9H251 3354 aa23.53■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 CHMLP26374 656 aa23.52■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 ITGA7Q13683 1181 aa23.52■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 ZNF697Q5TEC3 545 aa23.52■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 TBC1D5Q92609 795 aa23.52■■□□□ 1.36
HLA-B-250ENST00000434333 TLR3O15455 904 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 ZEB2O60315 1214 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PSMC6P62333 389 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PTH1RQ03431 593 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 QRICH1Q2TAL8 776 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 C16orf59Q7L2K0 433 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SLC17A8Q8NDX2 589 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 UBAC1Q9BSL1 405 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 JMJD4Q9H9V9 463 aa23.51■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 CYP21A2P08686 494 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PDE4DQ08499 809 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 STAG2Q8N3U4 1231 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 COL20A1Q9P218 1284 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 ABCB11O95342 1321 aa23.5■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 MYH6P13533 1939 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 CSF2RAP15509 400 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 MAF1Q9H063 256 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 TAF6LQ9Y6J9 622 aa23.49■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 EYSQ5T1H1 3165 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 B4GALT4O60513 344 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PURAQ00577 322 aaKnown RBP23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM240Q5SV17 173 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 RUFY2Q8WXA3 655 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SEMA6BQ9H3T3 888 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 UMODL1Q5DID0 1318 aa23.48■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SGSM2O43147 1006 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 ARIH2O95376 493 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 CYP2C18P33260 490 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 PPP2R5BQ15173 497 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 RASIP1Q5U651 963 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 FBXO11Q86XK2 927 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 TMEM199Q8N511 208 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 OR6J1Q8NGC5 347 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SCFD2Q8WU76 684 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 COPS5Q92905 334 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 MTMR8Q96EF0 704 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 TRPV6Q9H1D0 765 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 VAT1LQ9HCJ6 419 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 POLR3EQ9NVU0 708 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa23.47■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 OPLAHO14841 1288 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 CPT1AP50416 773 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 MAD2L2Q9UI95 211 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 A0A0C4DFX4 3053 aa23.46■■□□□ 1.35
HLA-B-250ENST00000434333 UNC80Q8N2C7 3258 aa23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.45■■□□□ 1.34
HLA-B-250ENST00000434333 ACRP10323 421 aa23.45■■□□□ 1.34
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