RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000429574.1

LIN28AP1-201, Transcript of LIN28A pseudogene 1, humanhuman

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Gene LIN28AP1, Length 405 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AP1-201ENST00000429574 PDGFCQ9NRA1 345 aa22.03■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 RPS6P62753 249 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC30A10Q6XR72 485 aa22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 WDR11Q9BZH6 1224 aa22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 ABCB11O95342 1321 aa22.02■■□□□ 1.12
LIN28AP1-201ENST00000429574 TIMP1P01033 207 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 ZNF697Q5TEC3 545 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 TAPT1Q6NXT6 567 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 CXCL17Q6UXB2 119 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 ADGRF4Q8IZF3 695 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 DNERQ8NFT8 737 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MORC4Q8TE76 937 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 SEZ6LQ9BYH1 1024 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 CPVLQ9H3G5 476 aa22.01■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYH6P13533 1939 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 SZT2Q5T011 3432 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 CHMLP26374 656 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 SART3Q15020 963 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 DUSP28Q4G0W2 176 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 C9orf50Q5SZB4 431 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 FBXO11Q86XK2 927 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM199Q8N511 208 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 ASTN1O14525 1302 aa22■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 CPT1AP50416 773 aa21.99■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 CDK7P50613 346 aa21.99■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 NKX3-2P78367 333 aa21.99■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 ITGA7Q13683 1181 aa21.99■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 RGS22Q8NE09 1264 aa21.99■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 OR6J1Q8NGC5 347 aa21.99■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 POLR3EQ9NVU0 708 aa21.99■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 ITGB8P26012 769 aa21.98■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPP2R5BQ15173 497 aa21.98■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.98■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 SCFD2Q8WU76 684 aa21.98■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MAF1Q9H063 256 aa21.98■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 CTAGE5O15320 804 aa21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MFSD5Q6N075 450 aa21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 NCOA7Q8NI08 942 aa21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MTMR10Q9NXD2 777 aa21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 LCTP09848 1927 aa21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 LRRC37A2A6NM11 1700 aa21.97■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 KLRF2D3W0D1 207 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 MYL3P08590 195 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 TRAF1Q13077 416 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 TTLL4Q14679 1199 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 QRICH1Q2TAL8 776 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM126BQ8IXS8 530 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM161BQ96MY7 647 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 AMNQ9BXJ7 453 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 IL25Q9H293 177 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 TBX21Q9UL17 535 aa21.96■■□□□ 1.11
LIN28AP1-201ENST00000429574 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa21.96■■□□□ 1.11
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LIN28AP1-201ENST00000429574 PTH1RQ03431 593 aa21.95■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 WTAPQ15007 396 aa21.95■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 ARHGEF16Q5VV41 709 aa21.95■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 CYB5R4Q7L1T6 521 aa21.95■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 JMJD4Q9H9V9 463 aa21.95■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 KPNA6O60684 536 aa21.94■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 CFBP00751 764 aa21.94■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 CYP21A2P08686 494 aa21.94■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 RMDN3Q96TC7 470 aa21.94■■□□□ 1.1
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LIN28AP1-201ENST00000429574 SGSM2O43147 1006 aa21.93■■□□□ 1.1
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LIN28AP1-201ENST00000429574 PSMC6P62333 389 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 SEC23AQ15436 765 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 STXBP2Q15833 593 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 LAMA3Q16787 3333 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM63BQ5T3F8 832 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 CATIPQ7Z7H3 387 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 IWS1Q96ST2 819 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 HIPK3Q9H422 1215 aa21.93■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 E7EWF7 191 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 EPHB4P54760 987 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 FAM47CQ5HY64 1035 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 TMEM67Q5HYA8 995 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 SEPT14Q6ZU15 432 aa21.92■■□□□ 1.1
LIN28AP1-201ENST00000429574 HOMER1Q86YM7 354 aa21.92■■□□□ 1.1
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