RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428284.2

HOXA4-202, Transcript of homeobox A4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene HOXA4, Length 1,595 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4-202ENST00000428284 NPY5RQ15761 445 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 UBE2SQ16763 222 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MCTP1Q6DN14 999 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 USP17L6PQ6QN14 398 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 DAGLBQ8NCG7 672 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 RGS22Q8NE09 1264 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 TBC1D5Q92609 795 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 IVNS1ABPQ9Y6Y0 642 aa23.63■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MYH7BA7E2Y1 1941 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 LBX1P52954 281 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 KCTD2Q14681 263 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 SLC30A10Q6XR72 485 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MMP19Q99542 508 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 TSKSQ9UJT2 592 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PFASO15067 1338 aa23.62■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3CDO00329 1044 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MEIS2O14770 477 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 ADAMTS3O15072 1205 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 FCER1AP12319 257 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 RPS6P62753 249 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 SP3Q02447 781 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 GPR142Q7Z601 462 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 RASGRP4Q8TDF6 673 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 OXER1Q8TDS5 423 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MYH15Q9Y2K3 1946 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF236Q9UL36 1845 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 BTBD18B2RXH4 712 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 HSD17B4P51659 736 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PKP1Q13835 747 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PLEKHH3Q7Z736 793 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 CYP39A1Q9NYL5 469 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MTMR6Q9Y217 621 aa23.61■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 GPR25O00155 361 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 GHRHRQ02643 423 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 NR5A1Q13285 461 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 FCHSD1Q86WN1 690 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 TEX2Q8IWB9 1127 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 TMEM260Q9NX78 707 aa23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.6■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 DDIT3P35638 169 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHA6Q9UN73 950 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa23.59■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 STRNO43815 780 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 CLK2P49760 499 aaKnown RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 FCGRTP55899 365 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 KIF22Q14807 665 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 FERMT3Q86UX7 667 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PGBD1Q96JS3 809 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MAF1Q9H063 256 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 PRDM10Q9NQV6 1147 aa23.58■■□□□ 1.37
HOXA4-202ENST00000428284 MCM3APO60318 1980 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 KIF28PB7ZC32 967 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 M0R2N6 131 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 PTPREP23469 700 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 PSMC4P43686 418 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 AP3B2Q13367 1082 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 POTEB2H3BUK9 544 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 PGK2P07205 417 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ADORA2AP29274 412 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ABRAQ8N0Z2 381 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 COL20A1Q9P218 1284 aa23.57■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 SLC15A5A6NIM6 579 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 FOSP01100 380 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 CTGFP29279 349 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 NUCB2P80303 420 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 GRB14Q14449 540 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 MCTP2Q6DN12 878 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 KRT25Q7Z3Z0 450 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ANO3Q9BYT9 981 aa23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP23.56■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 FKTNO75072 461 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP23.55■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 NOSTRINQ8IVI9 506 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 CD99L2Q8TCZ2 262 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP23.55■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 TNFRSF25Q93038 417 aa23.55■■□□□ 1.36
HOXA4-202ENST00000428284 TRIM47Q96LD4 638 aa23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.1 ms