RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428120.5

FAAP20-209, Transcript of FA core complex associated protein 20, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene FAAP20, Length 2,313 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAAP20-209ENST00000428120 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 FKBP1CQ5VVH2 108 aa26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC84Q86UT8 332 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 AMNQ9BXJ7 453 aa26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 SYNRGQ9UMZ2 1314 aa26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 SPTLC3Q9NUV7 552 aa26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 CTNND2Q9UQB3 1225 aa26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa26.16■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 POTEMA6NI47 508 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 FAM83AQ86UY5 434 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 LRWD1Q9UFC0 647 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO11Q86XK2 927 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 INTS13Q9NVM9 706 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 GDAQ9Y2T3 454 aa26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 R3HCC1Q9Y3T6 440 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 CBFA2T2O43439 604 aa26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 FAM83BQ5T0W9 1011 aa26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 P2RX7Q99572 595 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 KBTBD4Q9NVX7 518 aa26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 IMPACTQ9P2X3 320 aa26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 PRR12Q9ULL5 1215 aa26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 TMX2Q9Y320 296 aa26.14■■□□□ 1.78
FAAP20-209ENST00000428120 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 TNIP1Q15025 636 aa26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 PPP4R3AQ6IN85 833 aa26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 PGAP2Q9UHJ9 254 aa26.14■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SMCHD1A6NHR9 2005 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 MEIS2O14770 477 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 RASA3Q14644 834 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SKILP12757 684 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 STAT2P52630 851 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 TMEM266Q2M3C6 531 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 ARMCX5Q6P1M9 558 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 ANO3Q9BYT9 981 aa26.13■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GSDMDP57764 484 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CCZ1BP86790 482 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SPATA1Q5VX52 437 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 HAS1Q92839 578 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GOPCQ9HD26 462 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 RMND1Q9NWS8 449 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GJA3Q9Y6H8 435 aa26.12■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D12O60347 775 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CAP2P40123 477 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 PRELPP51888 382 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 BTNL9Q6UXG8 535 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 ASTN2O75129 1339 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 KMT5BQ4FZB7 885 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SAMD7Q7Z3H4 446 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CALML4Q96GE6 196 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SGIP1Q9BQI5 828 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GLT8D2Q9H1C3 349 aa26.11■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 MARCH6O60337 910 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 VSTM4Q8IW00 320 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 KLRC4O43908 158 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GRB10Q13322 594 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 NUDT12Q9BQG2 462 aa26.1■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 PRCPP42785 496 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 MICALL2Q8IY33 904 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 KIFC2Q96AC6 838 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 OPLAHO14841 1288 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CUEDC2Q9H467 287 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CD2APQ9Y5K6 639 aa26.09■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8FQ08AF8 430 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GOLGA8DPQ0D2H9 430 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC174Q6PII3 467 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 NLGN2Q8NFZ4 835 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 SNX29Q8TEQ0 813 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 NELFBQ8WX92 580 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 PNMA5Q96PV4 448 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 RAB34Q9BZG1 259 aa26.08■■□□□ 1.77
FAAP20-209ENST00000428120 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 PAK1Q13153 545 aa26.08■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa26.08■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 TRIM9Q9C026 710 aa26.08■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 VCPKMTQ9H867 229 aa26.08■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 MYL1P05976 194 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 PDIA5Q14554 519 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 CCDC150Q8NCX0 1101 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 MAGEF1Q9HAY2 307 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 FBXO28Q9NVF7 368 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 PCDHA12Q9UN75 941 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 SPDYE3A6NKU9 549 aa26.06■■□□□ 1.76
FAAP20-209ENST00000428120 ASIC1P78348 528 aa26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 108.2 ms