RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428064.5

LIMS1-208, Transcript of LIM zinc finger domain containing 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIMS1, Length 637 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMS1-208ENST00000428064 CXCL17Q6UXB2 119 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 SLC30A10Q6XR72 485 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 RNF207Q6ZRF8 634 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 EEPD1Q7L9B9 569 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 PNMA1Q8ND90 353 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 RGS22Q8NE09 1264 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 DNERQ8NFT8 737 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.61■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP24.6■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 KDM4AO75164 1064 aa24.6■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP24.6■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa24.6■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP24.6■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZKSCAN3Q9BRR0 538 aa24.6■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 EYSQ5T1H1 3165 aa24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 EDNRBP24530 442 aa24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 RPS6P62753 249 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 CNNM2Q9H8M5 875 aa24.59■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 B4E1Z4 1266 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 ITGA7Q13683 1181 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 ASPRV1Q53RT3 343 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM199Q8N511 208 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 FAM161BQ96MY7 647 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 KRT23Q9C075 422 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 SEMA6BQ9H3T3 888 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 KAT14Q9H8E8 782 aa24.58■■□□□ 1.53
LIMS1-208ENST00000428064 GRIN2DO15399 1336 aa24.58■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 A0A0C4DFX4 3053 aa24.58■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 CALML3P27482 149 aa24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM63BQ5T3F8 832 aa24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 WDR11Q9BZH6 1224 aa24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 ZSWIM5Q9P217 1185 aa24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 TNKSO95271 1327 aa24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 RAD50Q92878 1312 aa24.57■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 HSFX4A0A1B0GTS1 333 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 HSFX3A0A1B0GWH4 333 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP24.56■■□□□ 1.526e-6■■□□□ 11.7
LIMS1-208ENST00000428064 GOLGA8HP0CJ92 632 aa24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PTGS1P23219 599 aa24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 CPT1AP50416 773 aa24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 RASIP1Q5U651 963 aa24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 POLR3EQ9NVU0 708 aa24.56■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 B4DLN1 442 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 CSF2RAP15509 400 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PDE4DQ08499 809 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 CDC37Q16543 378 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 TMEM240Q5SV17 173 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 TTC22Q5TAA0 569 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 C16orf59Q7L2K0 433 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 ABCB11O95342 1321 aa24.55■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PDE4AP27815 886 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 USH1GQ495M9 461 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 ADGRF4Q8IZF3 695 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 SCFD2Q8WU76 684 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 UBA5Q9GZZ9 404 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 IL25Q9H293 177 aa24.54■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PURAQ00577 322 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PPP2R5BQ15173 497 aa24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 UBAC1Q9BSL1 405 aa24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 CPVLQ9H3G5 476 aa24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 HIPK3Q9H422 1215 aa24.53■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 B4GALT4O60513 344 aa24.52■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 PARP1P09874 1014 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 OR6J1Q8NGC5 347 aa24.52■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 IL23AQ9NPF7 189 aa24.52■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
LIMS1-208ENST00000428064 MYH6P13533 1939 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 SCN10AQ9Y5Y9 1956 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 DLL1O00548 723 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 DNAJB2P25686 324 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 CYP2C18P33260 490 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 PSMC6P62333 389 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MCF2L2Q86YR7 1114 aa24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 A6NJR5 290 aa24.5■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 SEC23AQ15436 765 aa24.5■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 QRICH1Q2TAL8 776 aa24.5■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 KPNA6O60684 536 aa24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 TTLL4Q14679 1199 aa24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 ZNF365Q70YC5 407 aa24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 HERVK_113Q902F9 699 aa24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 TRPV6Q9H1D0 765 aa24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 JMJD4Q9H9V9 463 aa24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP24.49■■□□□ 1.51
LIMS1-208ENST00000428064 SUPT20HL2P0C7V6 817 aa24.48■■□□□ 1.51
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