RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426951.5

RBM39-211, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene RBM39, Length 840 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-211ENST00000426951 TBX22Q9Y458 520 aa6.31□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PQ45 241 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PQY0 241 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 PSPNO60542 156 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 GALK1P51570 392 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KIR3DS1Q14943 382 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 NTRK3Q16288 839 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 INF2Q27J81 1249 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 HSF5Q4G112 596 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TMEM67Q5HYA8 995 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ZC3H12BQ5HYM0 836 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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RBM39-211ENST00000426951 SLCO6A1Q86UG4 719 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 CCDC103Q8IW40 242 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 MYLIPQ8WY64 445 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KISS1RQ969F8 398 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 PLCD4Q9BRC7 762 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SP110Q9HB58 689 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 GPR160Q9UJ42 338 aa6.3□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
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RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PQ64 194 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PQC6 194 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 A0A1W2PQD8 194 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 C7orf72A4D263 438 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 NOTOA8MTQ0 251 aa6.29□□□□□ -1.4
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RBM39-211ENST00000426951 SMARCA5O60264 1052 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 EFEMP2O95967 443 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SUMO1P63165 101 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 NR0B2Q15466 257 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 FYB2Q5VWT5 728 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 NLGN1Q8N2Q7 840 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 FLAD1Q8NFF5 587 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 DIO2Q92813 273 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 MMP19Q99542 508 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 FANCLQ9NW38 375 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TMEM260Q9NX78 707 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TAF6LQ9Y6J9 622 aa6.29□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 LCP1P13796 627 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 PRKCAP17252 672 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 LTBRP36941 435 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 AFMP43652 599 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 IQCEQ6IPM2 695 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ATG4DQ86TL0 474 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 SIRT2Q8IXJ6 389 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 LILRA2Q8N149 483 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 NUP43Q8NFH3 380 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 ABHD4Q8TB40 342 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 KIRREL1Q96J84 757 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 FMNL2Q96PY5 1086 aa6.28□□□□□ -1.4
RBM39-211ENST00000426951 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.28□□□□□ -1.4
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RBM39-211ENST00000426951 NPHS1O60500 1241 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MSL3P1P0C860 447 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 IRAK1P51617 712 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 KCNAB2Q13303 367 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 GALNT18Q6P9A2 607 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 HOMER1Q86YM7 354 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 DCAF4Q8WV16 495 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 APPBP2Q92624 585 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 RNF32Q9H0A6 362 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 BTG4Q9NY30 223 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 GULP1Q9UBP9 304 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 RWDD3Q9Y3V2 267 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa6.27□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ASXL2Q76L83 1435 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CCDC163A0A0D9SF12 145 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MSCO60682 206 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CDC45O75419 566 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ASMTLO95671 621 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 TACR1P25103 407 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 MVKQ03426 396 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 SDE2Q6IQ49 451 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 NLRX1Q86UT6 975 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 DPF3Q92784 378 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 ASIC4Q96FT7 647 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CHAMP1Q96JM3 812 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.26□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 BIN1O00499 593 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 RAPGEF3O95398 923 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 RPL11P62913 178 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 CYP4F8P98187 520 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 TESK1Q15569 626 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 TKFCQ3LXA3 575 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 STYK1Q6J9G0 422 aa6.25□□□□□ -1.41
RBM39-211ENST00000426951 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.25□□□□□ -1.41
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