RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000406506.3

HOXD12-202, Transcript of homeobox D12, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD12, Length 1,318 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD12-202ENST00000406506 UNC93B1Q9H1C4 597 aa22.29■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 SOWAHBA6NEL2 793 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 CCDC85CA6NKD9 419 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 CALML3P27482 149 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 GHRHRQ02643 423 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 TBC1D5Q92609 795 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa22.28■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 RPTORQ8N122 1335 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 SYNGAP1Q96PV0 1343 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 CYBAP13498 195 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 IFNAR1P17181 557 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 RABEP1Q15276 862 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 MAMDC4Q6UXC1 1216 aa22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 GPKOWQ92917 476 aaPredicted RBP eCLIP22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 V9GY48 417 aaPredicted RBP22.27■■□□□ 1.16
HOXD12-202ENST00000406506 PFKFB2O60825 505 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 LARGE1O95461 756 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 CFBP00751 764 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 HSD17B4P51659 736 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 WWC2Q6AWC2 1192 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PHKBQ93100 1093 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 XRN2Q9H0D6 950 aaKnown RBP eCLIP22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 RNF208Q9H0X6 261 aa22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP22.26■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 CCND3P30281 292 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
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HOXD12-202ENST00000406506 ARMCX2Q7L311 632 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 TRPV1Q8NER1 839 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 COL20A1Q9P218 1284 aa22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 ADD3Q9UEY8 706 aaKnown RBP22.25■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 ASB14A6NK59 587 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 hCG_1984214I3L0E3 225 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 CPLX1O14810 134 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PPFIA3O75145 1194 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 ME3Q16798 604 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 SAMD3Q8N6K7 520 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 TMEM106CQ9BVX2 250 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 NRBP1Q9UHY1 535 aa22.24■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 SNAI1O95863 264 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 SCG2P13521 617 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 SOX10P56693 466 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 DNERQ8NFT8 737 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 GTF3C6Q969F1 213 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 SLC26A6Q9BXS9 759 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 CNPY2Q9Y2B0 182 aa22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 STXBP3O00186 592 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 GJB1P08034 283 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 POLR2MP0CAP2 368 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PKN1Q16512 942 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 PRAMEF19Q5SWL8 479 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 MORC4Q8TE76 937 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 BARHL2Q9NY43 387 aa22.22■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 POTEFA5A3E0 1075 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 NAPAP54920 295 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
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HOXD12-202ENST00000406506 NECAB1Q8N987 351 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 DEFB118Q96PH6 123 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 TAAR1Q96RJ0 339 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa22.21■■□□□ 1.15
HOXD12-202ENST00000406506 CDKL5O76039 1030 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 ZNF865P0CJ78 1059 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 EDNRBP24530 442 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 RMDN3Q96TC7 470 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 KATNBL1Q9H079 304 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 ABHD16BQ9H3Z7 469 aa22.2■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 PIK3CDO00329 1044 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 MEIS2O14770 477 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 ST18O60284 1047 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 CAPN15O75808 1086 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 CNGA1P29973 690 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 IL27Q8NEV9 243 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 U2AF1L4Q8WU68 220 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 SHISA4Q96DD7 197 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.19■■□□□ 1.14
HOXD12-202ENST00000406506 PXMP2Q9NR77 195 aa22.19■■□□□ 1.14
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