RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000395713.6

TRPS1-202, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 3

Gene TRPS1, Length 581 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-202ENST00000395713 TMEM52Q8NDY8 209 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-202ENST00000395713 PTCHD1Q96NR3 888 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-202ENST00000395713 CLUHP3Q96NS8 147 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-202ENST00000395713 FEZ1Q99689 392 aa6.72□□□□□ -1.33
TRPS1-202ENST00000395713 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ENDOUP21128 410 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 RALGPS1Q5JS13 557 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 NFXL1Q6ZNB6 911 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 NAT16Q8N8M0 369 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 FLCNQ8NFG4 579 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ADAMTS10Q9H324 1103 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PRDM7Q9NQW5 492 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ERVK13-1Q9NX77 482 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SLAMF8Q9P0V8 285 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 EBF1Q9UH73 591 aa6.71□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ADAMTS4O75173 837 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PAMP19021 973 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 FNDC3BQ53EP0 1204 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 KCNT2Q6UVM3 1135 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 CPNE8Q86YQ8 564 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 CCDC103Q8IW40 242 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SLC7A14Q8TBB6 771 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PTPRN2Q92932 1015 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 FCRL2Q96LA5 508 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PAK6Q9NQU5 681 aaPredicted RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 NDOR1Q9UHB4 597 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TRAF6Q9Y4K3 522 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 FGD5Q6ZNL6 1462 aa6.7□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ASXL2Q76L83 1435 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 NPHP3-ACAD11A0A0J9YXS1 232 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TBC1D8O95759 1140 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 LCP1P13796 627 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 GABREP78334 506 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 LAPTM5Q13571 262 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 DCAF4Q8WV16 495 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 DIO2Q92813 273 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ALPK1Q96QP1 1244 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 MMP19Q99542 508 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 G6PC3Q9BUM1 346 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SLC52A2Q9HAB3 445 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PCMTD2Q9NV79 361 aa6.69□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 WDR97A6NE52 1622 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ANKRD62A6NC57 917 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 RFPL3O75679 317 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ZGLP1P0C6A0 271 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 FUT4P22083 530 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TESK1Q15569 626 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 INF2Q27J81 1249 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TRIM61Q5EBN2 209 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 MBLAC2Q68D91 279 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 IQCEQ6IPM2 695 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 STYK1Q6J9G0 422 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 CYP2R1Q6VVX0 501 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 NINJ1Q92982 152 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 MAP6Q96JE9 813 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 HHIPL1Q96JK4 782 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PHF20Q9BVI0 1012 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SFMBT1Q9UHJ3 866 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.68□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TRBV23OR9-2A0A075B6M9 112 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 FADS2P1A8MWK0 482 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 MSCO60682 206 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 WNT11O96014 354 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SDSP20132 328 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 LTBRP36941 435 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 DUSP4Q13115 394 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 HLA-DQA1Q5Y7H0 255 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 NIM1KQ8IY84 436 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 RCBTB1Q8NDN9 531 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 GSTCDQ8NEC7 633 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PI4K2BQ8TCG2 481 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TNFRSF10DQ9UBN6 386 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TMEM59LQ9UK28 342 aa6.67□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 KCNQ2O43526 872 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 EFCAB14O75071 495 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 USP2O75604 605 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 HK2P52789 917 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 KCNAB2Q13303 367 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TAF7LQ5H9L4 462 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 SLC23A3Q6PIS1 610 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 RSPO2Q6UXX9 243 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 BRAPQ7Z569 592 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 FGD2Q7Z6J4 655 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 TP53INP2Q8IXH6 220 aa6.66□□□□□ -1.34
TRPS1-202ENST00000395713 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
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