RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392415.6

UBE2E3-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene UBE2E3, Length 1,347 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3-201ENST00000392415 EEPD1Q7L9B9 569 aa23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3-201ENST00000392415 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM87BQ96K49 555 aa23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3-201ENST00000392415 RIOX1Q9H6W3 641 aa23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3-201ENST00000392415 PDGFCQ9NRA1 345 aa23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3-201ENST00000392415 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
UBE2E3-201ENST00000392415 ZBTB5O15062 677 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 BMP8BP34820 402 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 ACLYP53396 1101 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 KCNA10Q16322 511 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC35G1Q2M3R5 365 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 RNF20Q5VTR2 975 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 IQSEC1Q6DN90 963 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TBC1D5Q92609 795 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K14Q99558 947 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 AMNQ9BXJ7 453 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 ATP11BQ9Y2G3 1177 aa23.95■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 SZT2Q5T011 3432 aa23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 CTAGE5O15320 804 aa23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 SLC34A2O95436 690 aa23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 EDNRBP24530 442 aa23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TMTC2Q8N394 836 aa23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PCSK9Q8NBP7 692 aaKnown RBP23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP23.94■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 A0A1W2PPC1 479 aa23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 SH2B2O14492 632 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 CYTH3O43739 400 aa23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 SMPD1P17405 629 aa23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TRIM60Q495X7 471 aa23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 ZNF654Q8IZM8 581 aa23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 NUP133Q8WUM0 1156 aa23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP23.93■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 DDAH1O94760 285 aa23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 LIFRP42702 1097 aa23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 FXR1P51114 621 aaKnown RBP eCLIP23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 GNASQ5JWF2 1037 aa23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 STARD7Q9NQZ5 370 aa23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 Q9Y3F1 56 aa23.92■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 RBM47A0AV96 593 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 B4DLN1 442 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 ASGR1P07306 291 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 GHRHRQ02643 423 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PDE4DQ08499 809 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TSGA10IPQ3SY00 556 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TLK2Q86UE8 772 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PIGSQ96S52 555 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 COL20A1Q9P218 1284 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 ELP1O95163 1332 aa23.91■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 OPLAHO14841 1288 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TLE2Q04725 743 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TRAF1Q13077 416 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 DUSP28Q4G0W2 176 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TMEM63BQ5T3F8 832 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 ERICH6BQ5W0A0 696 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 HOMER1Q86YM7 354 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 GLT1D1Q96MS3 346 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 NEK1Q96PY6 1258 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 TAAR1Q96RJ0 339 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 MYL10Q9BUA6 226 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PRKAG2Q9UGJ0 569 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDHA1Q9Y5I3 950 aa23.9■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 CCDC69A6NI79 296 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 KIF5BP33176 963 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 RASEFQ8IZ41 740 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 NSUN6Q8TEA1 469 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 WDR11Q9BZH6 1224 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 AP5M1Q9H0R1 490 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 PCDH10Q9P2E7 1040 aa23.89■■□□□ 1.42
UBE2E3-201ENST00000392415 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 CFBP00751 764 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 PTGS1P23219 599 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 SMARCA1P28370 1054 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 HSD17B4P51659 736 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 BEX3Q00994 111 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 NFXL1Q6ZNB6 911 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.88■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 SGMS1Q86VZ5 419 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 SAMD3Q8N6K7 520 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 TOX2Q96NM4 488 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 IWS1Q96ST2 819 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 RMDN3Q96TC7 470 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 LZTS2Q9BRK4 669 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 SPZ1Q9BXG8 430 aa23.87■■□□□ 1.41
UBE2E3-201ENST00000392415 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.8 ms