RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC25BP30305 580 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 TBC1D10CQ8IV04 446 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 ERCC6L2Q5T890 1561 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 NAA35Q5VZE5 725 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM184BQ9ULE4 1060 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 TRPC6Q9Y210 931 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 A2ML1A8K2U0 1454 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 PSMC4P43686 418 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 C1orf112Q9NSG2 853 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 PALLDQ8WX93 1383 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 MEIS1O00470 390 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 CTNNA1P35221 906 aaKnown RBP18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 CEP85LQ5SZL2 805 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 SDAD1Q9NVU7 687 aaKnown RBP eCLIP18.9■□□□□ 0.622e-8■■■■■ 32.7
SH3BP4-202ENST00000392011 STIM2Q9P246 746 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC23Q9UJX2 597 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa18.9■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 LRRIQ4A6NIV6 560 aa18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 PRDX5P30044 214 aa18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 INPP5BP32019 993 aa18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF658Q5TYW1 1059 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.89■□□□□ 0.62
SH3BP4-202ENST00000392011 MTMR3Q13615 1198 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 DENND2CQ68D51 928 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 BCORL1Q5H9F3 1711 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 A6NNZ2 444 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 SNX16P57768 344 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 FKBP3Q00688 224 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 TUBB8Q3ZCM7 444 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 TET3O43151 1660 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 TAOK1Q7L7X3 1001 aa18.89■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 TBC1D8O95759 1140 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP2D6P10635 497 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 PPANQ9NQ55 473 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 TSPOAP1O95153 1857 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 SHROOM2Q13796 1616 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 HSPA1LP34931 641 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 UBE2SQ16763 222 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 HHATQ5VTY9 493 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CASC4Q6P4E1 433 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CROCCP2Q86T23 111 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 RAB3IL1Q8TBN0 382 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 VPS37BQ9H9H4 285 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CDK8P49336 464 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 MAP7D1Q3KQU3 841 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ABCC12Q96J65 1359 aa18.88■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 RAD17O75943 681 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 BMP3P12645 472 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 PLCG1P19174 1290 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 GRAPQ13588 217 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CCDC89Q8N998 374 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 POMGNT1Q8WZA1 660 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CLTCL1P53675 1640 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 VSIG1Q86XK7 387 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ZBTB8OSQ8IWT0 167 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 MGARPQ8TDB4 240 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 PAGE5Q96GU1 130 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ZNF577Q9BSK1 485 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ADCY10Q96PN6 1610 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CLIC2O15247 247 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ACRBPQ8NEB7 543 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ITIH3Q06033 890 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 BSPRYQ5W0U4 402 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CYB5R4Q7L1T6 521 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKRD42Q8N9B4 389 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 MAIP1Q8WWC4 291 aa18.87■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 RGS16O15492 202 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ATP1A2P50993 1020 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 YARSP54577 528 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ARID5BQ14865 1188 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 NCAPG2Q86XI2 1143 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 CPVLQ9H3G5 476 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 TTLL3Q9Y4R7 772 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 TMC4Q7Z404 712 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 SOWAHDA6NJG2 315 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 MAN2A1Q16706 1144 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 FYB2Q5VWT5 728 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 GADL1Q6ZQY3 521 aa18.86■□□□□ 0.61
SH3BP4-202ENST00000392011 STK10O94804 968 aaKnown RBP18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.4 ms