RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000380828.6

RABGEF1-202, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

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Gene RABGEF1, Length 3,864 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-202ENST00000380828 M0QX08 132 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 FERP16591 822 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 MLH1P40692 756 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 HAAOP46952 286 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 TAS1R3Q7RTX0 852 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 TSC22D3Q99576 134 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 SEPT10Q9P0V9 454 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 KRBA1A5PL33 1030 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.56□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP7.56□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 RTCAO00442 366 aaKnown RBP7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 YY1P25490 414 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 ODR4Q5SWX8 454 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 MYPNQ86TC9 1320 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 GIMAP5Q96F15 307 aa7.55□□□□□ -1.2
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RABGEF1-202ENST00000380828 TNNQ9UQP3 1299 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 NRKQ7Z2Y5 1582 aa7.55□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.54□□□□□ -1.2
RABGEF1-202ENST00000380828 ERICH2A1L162 156 aa7.54□□□□□ -1.2
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