RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376303.6

SYP-202, Transcript of synaptophysin, humanhuman

TSL 2

Gene SYP, Length 858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-202ENST00000376303 CXCL17Q6UXB2 119 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 SLC43A3Q8NBI5 491 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 ANKS1AQ92625 1134 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 FAM161BQ96MY7 647 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 GUCD1Q96NT3 240 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 KAT14Q9H8E8 782 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 CDH23Q9H251 3354 aa20.64■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 B4E1Z4 1266 aa20.63■□□□□ 0.89
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SYP-202ENST00000376303 DNERQ8NFT8 737 aa20.63■□□□□ 0.89
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SYP-202ENST00000376303 TMEM199Q8N511 208 aa20.62■□□□□ 0.89
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SYP-202ENST00000376303 SEMA6BQ9H3T3 888 aa20.61■□□□□ 0.89
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SYP-202ENST00000376303 PDE4DQ08499 809 aa20.6■□□□□ 0.89
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SYP-202ENST00000376303 BUD13Q9BRD0 619 aaKnown RBP eCLIP20.6■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 UNC80Q8N2C7 3258 aa20.59■□□□□ 0.89
SYP-202ENST00000376303 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.59■□□□□ 0.89
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SYP-202ENST00000376303 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.57■□□□□ 0.88
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SYP-202ENST00000376303 BRDTQ58F21 947 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 TMEM240Q5SV17 173 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 C16orf59Q7L2K0 433 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 OR6J1Q8NGC5 347 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 SCFD2Q8WU76 684 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 HIPK3Q9H422 1215 aa20.57■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 CYP2C18P33260 490 aa20.56■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 PSMC6P62333 389 aa20.56■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.56■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 EYSQ5T1H1 3165 aa20.56■□□□□ 0.88
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SYP-202ENST00000376303 QRICH1Q2TAL8 776 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 ZNF365Q70YC5 407 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 FBXO11Q86XK2 927 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 TRPV6Q9H1D0 765 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 JMJD4Q9H9V9 463 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 IL23AQ9NPF7 189 aa20.55■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP20.55■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 MYL3P08590 195 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 ACRP10323 421 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 TXNP10599 105 aaKnown RBP20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 DNAJB2P25686 324 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 TTLL4Q14679 1199 aa20.54■□□□□ 0.88
SYP-202ENST00000376303 SEC23AQ15436 765 aa20.54■□□□□ 0.88
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