RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000373436.5

RALGPS1-204, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 1,667 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-204ENST00000373436 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.91■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 ABCB11O95342 1321 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 NAPAP54920 295 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 RCOR1Q9UKL0 485 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 OXER1Q8TDS5 423 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 TRERF1Q96PN7 1200 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 SH3GLB2Q9NR46 395 aa22.9■■□□□ 1.26
RALGPS1-204ENST00000373436 CCNA1P78396 465 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 NR5A1Q13285 461 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 PPP1R18Q6NYC8 613 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 RNF146Q9NTX7 359 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 TMEM63CQ9P1W3 806 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CLIC4Q9Y696 253 aa22.89■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 SLC25A27O95847 323 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ERCC3P19447 782 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 KRT2P35908 639 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 TKFCQ3LXA3 575 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 MUM1L1Q5H9M0 696 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 NCAPG2Q86XI2 1143 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 PGBD1Q96JS3 809 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 PORCNQ9H237 461 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 POLR3EQ9NVU0 708 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 SAGE1Q9NXZ1 904 aa22.88■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 OPLAHO14841 1288 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CCDC148Q8NFR7 591 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CLEC4DQ8WXI8 215 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 BEGAINQ9BUH8 593 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 NFIBO00712 420 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 COPB2P35606 906 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 NASPP49321 788 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 NLRP5P59047 1200 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 STK38Q15208 465 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ANO1Q5XXA6 986 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 SHCBP1Q8NEM2 672 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CHST13Q8NET6 341 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ZMYND12Q9H0C1 365 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ACAD9Q9H845 621 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 EFCC1Q9HA90 598 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 BRMS1Q9HCU9 246 aa22.87■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 SMCO2A6NFE2 343 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 NPY5RQ15761 445 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 LINC00301Q8NCQ3 95 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 MROH8Q9H579 483 aa22.86■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 DOCK3Q8IZD9 2030 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ESYT2A0FGR8 921 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 YEATS4O95619 227 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ZSCAN23Q3MJ62 389 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 WDR78Q5VTH9 848 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 PSTPIP2Q9H939 334 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 WBP1LQ9NX94 342 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 FBXO40Q9UH90 709 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 MGAMO43451 1857 aa22.85■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 PLXNB2O15031 1838 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 ADCY7P51828 1080 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 BICD2Q8TD16 824 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 TBC1D5Q92609 795 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CUL5Q93034 780 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 C6orf50Q9HD87 102 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 RIC8AQ9NPQ8 531 aa22.84■■□□□ 1.25
RALGPS1-204ENST00000373436 CALML3P27482 149 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 GNA11P29992 359 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 MAPK4P31152 587 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 ME1P48163 572 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 MCF2L2Q86YR7 1114 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.83■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 SPTLC2O15270 562 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 CFBP00751 764 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 LIG1P18858 919 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 NSMFQ6X4W1 530 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 JMYQ8N9B5 988 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 TNFRSF25Q93038 417 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 PCDHA4Q9UN74 947 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 ZSWIM8A7E2V4 1837 aa22.82■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 FAM205CA6NFA0 338 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 GPR25O00155 361 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 MEIS2O14770 477 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 ADAMTS3O15072 1205 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 SP3Q02447 781 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 GALNT17Q6IS24 598 aa22.81■■□□□ 1.24
RALGPS1-204ENST00000373436 USP17L6PQ6QN14 398 aa22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 200.4 ms