RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000367379.5

PTPRC-204, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 517 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-204ENST00000367379 POU4F1Q01851 419 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-204ENST00000367379 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP8.07□□□□□ -1.12
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PTPRC-204ENST00000367379 FAM86C1Q9NVL1 165 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-204ENST00000367379 DIS3Q9Y2L1 958 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-204ENST00000367379 PCDHGB7Q9Y5F8 929 aa8.07□□□□□ -1.12
PTPRC-204ENST00000367379 LTBP3Q9NS15 1303 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-204ENST00000367379 A0A1W2PQJ5 194 aa8.06□□□□□ -1.12
PTPRC-204ENST00000367379 CD3EP07766 207 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRC-204ENST00000367379 TOPBP1Q92547 1522 aa8.06□□□□□ -1.12
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PTPRC-204ENST00000367379 PRICKLE3O43900 615 aaPredicted RBP8.03□□□□□ -1.12
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PTPRC-204ENST00000367379 RTP5Q14D33 572 aa8.03□□□□□ -1.12
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PTPRC-204ENST00000367379 ADGRG2Q8IZP9 1017 aa8.02□□□□□ -1.13
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PTPRC-204ENST00000367379 GBP3Q9H0R5 595 aa7.98□□□□□ -1.13
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PTPRC-204ENST00000367379 PAK2Q13177 524 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-204ENST00000367379 SLC9A5Q14940 896 aa7.97□□□□□ -1.13
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PTPRC-204ENST00000367379 BORCS6Q96GS4 357 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-204ENST00000367379 RCC1LQ96I51 464 aaKnown RBP7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-204ENST00000367379 SPATA32Q96LK8 384 aa7.97□□□□□ -1.13
PTPRC-204ENST00000367379 CRBNQ96SW2 442 aa7.97□□□□□ -1.13
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