RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362825.1

RNU6-1128P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1128, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1128P, Length 109 nt, Biotype snRNA, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADRB1P08588 477 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CHTF8P0CG12 524 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PMELP40967 661 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CTSOP43234 321 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FGD1P98174 961 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TLE4Q04727 773 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNK2Q07912 1038 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM25Q14258 630 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF169Q14929 603 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DBN1Q16643 649 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ERFEQ4G0M1 354 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CRIP3Q6Q6R5 217 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZPB1 254 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZSA8 131 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BRINP3Q76B58 766 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 DTX2Q86UW9 622 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TMEM40Q8WWA1 233 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TNFRSF25Q93038 417 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CCDC138Q96M89 665 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WRAP53Q9BUR4 548 aaKnown RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SERINC1Q9NRX5 453 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 P2RX2Q9UBL9 471 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF70Q9UC06 446 aaPredicted RBP-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KCNN3Q9UGI6 736 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAM29Q9UKF5 820 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KNTC1P50748 2209 aa-2.6□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZMYM3Q14202 1370 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FLT1P17948 1338 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IGKV1-6A0A0C4DH72 117 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GUL7 405 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LCHNA4D1U4 455 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 B4E1Z4 1266 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HAX1O00165 279 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNOT3O75175 753 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 WDR47O94967 919 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARSAP15289 507 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TKTP29401 623 aaKnown RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLA2G5P39877 138 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CD300EQ496F6 205 aaPredicted RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NBPF14Q5TI25 921 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF776Q68DI1 518 aaPredicted RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF497Q6ZNH5 498 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 P3H2Q8IVL5 708 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RGL4Q8IZJ4 473 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q8N1X5 172 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LRTM2Q8N967 370 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SLC10A4Q96EP9 437 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RNF5Q99942 180 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OSBPL10Q9BXB5 764 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRORYQ9H606 182 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM45Q9H8W5 580 aaPredicted RBP-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa-2.61□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CGB1A6NKQ9 187 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 H7C1D1 291 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 I6L893 689 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FCHO1O14526 889 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TIMM44O43615 452 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VENTXO95231 258 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ZNF883P0CG24 379 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPP3CBP16298 524 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ADAM8P78325 824 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HGFACQ04756 655 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BNIP3Q12983 259 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PLD1Q13393 1074 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NKAPLQ5M9Q1 402 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 ARMC4Q5T2S8 1044 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIAA0319Q5VV43 1072 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CGB2Q6NT52 195 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZTC4 211 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 Q6ZVH6 145 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 BHLHA15Q7RTS1 189 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRRT2Q7Z6L0 340 aaPredicted RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KSR1Q8IVT5 923 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 REXO1L1PQ8IX06 675 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GJD3Q8N144 294 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 LARGE2Q8N3Y3 721 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PRR18Q8N4B5 295 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 NAT8LQ8N9F0 302 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GALNT6Q8NCL4 622 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 SMRP1Q8NCR6 262 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 TRIM41Q8WV44 630 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 HGDQ93099 445 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 GUCD1Q96NT3 240 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 RANBP9Q96S59 729 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 IMUPQ9GZP8 106 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 VPS37BQ9H9H4 285 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 FRRS1LQ9P0K9 344 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 PPARGC1AQ9UBK2 798 aaKnown RBP-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 CNTNAP1P78357 1384 aa-2.62□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MN1Q10571 1320 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 MAST2Q6P0Q8 1798 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 KIR2DP1A0A0G2JNF4 349 aaPredicted RBP-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1B0GVC2 190 aa-2.63□□□□□ -2.83
RNU6-1128P-201ENST00000362825 A0A1W2PPI3 338 aa-2.63□□□□□ -2.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.9 ms