RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 LARGE1O95461 756 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 C6orf222P0C671 652 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CETN2P41208 172 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KLHL40Q2TBA0 621 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 DEFB115Q30KQ5 88 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TBC1D5Q92609 795 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CLIC6Q96NY7 704 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ABCB11O95342 1321 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CETN3O15182 167 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 AKR1B10O60218 316 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 EPB41P11171 864 aaKnown RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MMP14P50281 582 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZNF543Q08ER8 600 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TMC6Q7Z403 805 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NUDT12Q9BQG2 462 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PRDM5Q9NQX1 630 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.87□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKRD62A6NC57 917 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 COPB2P35606 906 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 LIG4P49917 911 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 UBASH3AP57075 661 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GRM4Q14833 912 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MOB2Q70IA6 237 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SESTD1Q86VW0 696 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KCNG1Q9UIX4 513 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ASB14A6NK59 587 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TNNI1P19237 187 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 BACE1P56817 501 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KARSQ15046 597 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CERS5Q8N5B7 392 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ANKFY1Q9P2R3 1169 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MTMR6Q9Y217 621 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 LRP6O75581 1613 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RFX7Q2KHR2 1363 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 K7ENM7 598 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MMP1P03956 469 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NOP2P46087 812 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GRIK5Q16478 980 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 WDR44Q5JSH3 913 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ODR4Q5SWX8 454 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 STOX1Q6ZVD7 989 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RIOK1Q9BRS2 568 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SERTAD1Q9UHV2 236 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 LRFN2Q9ULH4 789 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa7.86□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 AK9Q5TCS8 1911 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZBBXA8MT70 800 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PSAPP07602 524 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TXNP10599 105 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ARHGAP4P98171 946 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RAPGEF1Q13905 1077 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRP7Q8WX94 980 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TAF4BQ92750 862 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NLRP4Q96MN2 994 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NR1I2O75469 434 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 KIF4AO95239 1232 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CCDC172P0C7W6 258 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CDC27P30260 824 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CYP2J2P51589 502 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 FCGRTP55899 365 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 AP3B2Q13367 1082 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 GNL3Q9BVP2 549 aaKnown RBP eCLIP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TMEM260Q9NX78 707 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CACNB1Q02641 598 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 AGBL1Q96MI9 1066 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RPS6KC1Q96S38 1066 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CLIC4Q9Y696 253 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 A0A087WWV3 80 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CCP110O43303 1012 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 PDHBP11177 359 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TRAPPC10P48553 1259 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 TFDP1Q14186 410 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 NEDD9Q14511 834 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 ZFPM1Q8IX07 1006 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 C7orf31Q8N865 590 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 MB21D1Q8N884 522 aa7.85□□□□□ -1.15
LRRTM3-201ENST00000361320 RGS22Q8NE09 1264 aa7.85□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms