RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345425.6

GIPC1-201, Transcript of GIPC PDZ domain containing family member 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GIPC1, Length 1,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC1-201ENST00000345425 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP31.86■■■□□ 2.69
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GIPC1-201ENST00000345425 NPY5RQ15761 445 aa31.85■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 GPR142Q7Z601 462 aa31.85■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 DIS3L2Q8IYB7 885 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP31.85■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 MMP19Q99542 508 aa31.85■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 MEIS2O14770 477 aa31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 MCTP2Q6DN12 878 aa31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 PLEKHH3Q7Z736 793 aa31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 ABRAQ8N0Z2 381 aa31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 GPR25O00155 361 aa31.84■■■□□ 2.69
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GIPC1-201ENST00000345425 USP17L6PQ6QN14 398 aa31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 TBC1D5Q92609 795 aa31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 CYP39A1Q9NYL5 469 aa31.84■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP31.83■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 CEP350Q5VT06 3117 aa31.83■■■□□ 2.69
GIPC1-201ENST00000345425 PLXNB2O15031 1838 aa31.83■■■□□ 2.69
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GIPC1-201ENST00000345425 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 UBE2SQ16763 222 aa31.82■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 JMYQ8N9B5 988 aa31.82■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP31.82■■■□□ 2.68
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GIPC1-201ENST00000345425 AP3B2Q13367 1082 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 MCTP1Q6DN14 999 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 MTMR6Q9Y217 621 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 BTBD18B2RXH4 712 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 FOSP01100 380 aaPredicted RBP31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 PTPREP23469 700 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 DDIT3P35638 169 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 SLC30A10Q6XR72 485 aa31.81■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 PCNTO95613 3336 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 SPDYE3A6NKU9 549 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 M0R2N6 131 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 TNPO2O14787 897 aaKnown RBP31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 OXER1Q8TDS5 423 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA6Q9UN73 950 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 MGAMO43451 1857 aa31.8■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 SLC15A5A6NIM6 579 aa31.79■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 PSMC4P43686 418 aa31.79■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 GRB14Q14449 540 aa31.79■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa31.79■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 FCHSD1Q86WN1 690 aa31.79■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 RASGRP4Q8TDF6 673 aa31.79■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP31.79■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 FKTNO75072 461 aa31.78■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 NR5A1Q13285 461 aa31.78■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 KRT25Q7Z3Z0 450 aa31.78■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 ZNF236Q9UL36 1845 aa31.78■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 ZNFX1Q9P2E3 1918 aaKnown RBP31.77■■■□□ 2.68
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GIPC1-201ENST00000345425 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP31.77■■■□□ 2.68
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GIPC1-201ENST00000345425 NUCB2P80303 420 aa31.77■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 ERO1AQ96HE7 468 aa31.77■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 EHMT1Q9H9B1 1298 aa31.77■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 TMEM260Q9NX78 707 aa31.77■■■□□ 2.68
GIPC1-201ENST00000345425 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa31.76■■■□□ 2.68
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GIPC1-201ENST00000345425 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP31.76■■■□□ 2.67
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GIPC1-201ENST00000345425 SOCS4Q8WXH5 440 aa31.76■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 TNFRSF25Q93038 417 aa31.76■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 ANO3Q9BYT9 981 aa31.76■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 COL20A1Q9P218 1284 aa31.76■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 TSKSQ9UJT2 592 aa31.76■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 DNAJC25-GNG10A0A024R161 153 aa31.75■■■□□ 2.67
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GIPC1-201ENST00000345425 FAM133AQ8N9E0 248 aa31.74■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 DNERQ8NFT8 737 aa31.74■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa31.74■■■□□ 2.67
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GIPC1-201ENST00000345425 BRAPQ7Z569 592 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 DPP9Q86TI2 863 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 FERMT3Q86UX7 667 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 RMDN3Q96TC7 470 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa31.73■■■□□ 2.67
GIPC1-201ENST00000345425 CD99L2Q8TCZ2 262 aa31.73■■■□□ 2.67
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