RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311659.4

UBQLN3-201, Transcript of ubiquilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBQLN3, Length 2,407 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBQLN3-201ENST00000311659 LRRC15Q8TF66 581 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 TRIM47Q96LD4 638 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 DRC1Q96MC2 740 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 TSGA10Q9BZW7 698 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 SH2D4AQ9H788 454 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 JADE2Q9NQC1 790 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 KBTBD4Q9NVX7 518 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 FAM205AQ6ZU69 1335 aa9.46□□□□□ -0.89
UBQLN3-201ENST00000311659 MACROD2A1Z1Q3 448 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PSMA7O14818 248 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 LCA5LO95447 670 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TRIM21P19474 475 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 GNGT1P63211 74 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 KIF5AQ12840 1032 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TTMPQ5BVD1 217 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 SLC27A3Q5K4L6 730 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 KCNV1Q6PIU1 500 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 SPATA4Q8NEY3 305 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TRIM58Q8NG06 486 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 SMCR8Q8TEV9 937 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CAVIN3Q969G5 261 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ERGIC2Q96RQ1 377 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CEP89Q96ST8 783 aa9.46□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CYP2D7A0A087X1C5 515 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 RPS6KA4O75676 772 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CYP7A1P22680 504 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 LIG3P49916 1009 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 EPHB4P54760 987 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 EMBQ6PCB8 327 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 SMIM5Q71RC9 77 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 IQCA1Q86XH1 822 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF34Q8IZ26 560 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 DHTKD1Q96HY7 919 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 NCAPGQ9BPX3 1015 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 DEF6Q9H4E7 631 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 LRP2BPQ9P2M1 347 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 MAGEB6P1A0A0J9YX57 407 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PP2D1A8MPX8 630 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 M0R2N6 131 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PES1O00541 588 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 OPA1O60313 960 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PLEKP08567 350 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PCP11498 1178 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 NLRP5P59047 1200 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 SKIDA1Q1XH10 827 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ALS2CLQ60I27 953 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CCDC70Q6NSX1 233 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 KRT26Q7Z3Y9 468 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ARL8AQ96BM9 186 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 BRIP1Q9BX63 1249 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CCSER1Q9C0I3 900 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PLAGL2Q9UPG8 496 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 DDX52Q9Y2R4 599 aaKnown RBP eCLIP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF804BA4D1E1 1349 aa9.45□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 SHTN1A0MZ66 631 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 APBA3O96018 575 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CCNE1P24864 410 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TXNRD1Q16881 649 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 AMIGO3Q86WK7 504 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 POTEDQ86YR6 584 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CNPY4Q8N129 248 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 OSBPL9Q96SU4 736 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 HINFPQ9BQA5 517 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 STIM2Q9P246 746 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ZNF652Q9Y2D9 606 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 FLT1P17948 1338 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ZEB2O60315 1214 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TACC1O75410 805 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 TCP1P17987 556 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 HNRNPH1P31943 449 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 FNTAP49354 379 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 EMC10Q5UCC4 262 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 ANKRD40Q6AI12 368 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 P2RX5Q93086 422 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PAGR1Q9BTK6 254 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 UBR3Q6ZT12 1888 aa9.44□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 A6NNZ2 444 aa9.43□□□□□ -0.9
UBQLN3-201ENST00000311659 PLSCR1O15162 318 aa9.43□□□□□ -0.9
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.7 ms