RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000293889.10

CCDC78-201, Transcript of coiled-coil domain containing 78, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCDC78, Length 1,611 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78-201ENST00000293889 Q3C1V9 767 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 C17orf99Q6UX52 265 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 RIOX2Q8IUF8 465 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 RASGRP4Q8TDF6 673 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 TBC1D5Q92609 795 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 TNFRSF25Q93038 417 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GLT8D2Q9H1C3 349 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 RNF146Q9NTX7 359 aa20.37■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GPR25O00155 361 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 NFIBO00712 420 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 ERVK-9P63128 1117 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 ERVK-24P63145 666 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 TKFCQ3LXA3 575 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 USP17L6PQ6QN14 398 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GBP4Q96PP9 640 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHA6Q9UN73 950 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 PCDHA8Q9Y5H6 950 aa20.36■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 MGAMO43451 1857 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 MEIS2O14770 477 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 BCRP11274 1271 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 NOSTRINQ8IVI9 506 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 TMEM260Q9NX78 707 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 CFBP00751 764 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 CLK2P49760 499 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 FAM173BQ6P4H8 233 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 ZNF296Q8WUU4 475 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 MORF4L1Q9UBU8 362 aa20.35■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 FAM205CA6NFA0 338 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 PIK3CDO00329 1044 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 POLR2MP0CAP2 368 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 HOXA13P31271 388 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 BRAPQ7Z569 592 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 MCF2L2Q86YR7 1114 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 CHST13Q8NET6 341 aa20.34■□□□□ 0.85
CCDC78-201ENST00000293889 SLC25A27O95847 323 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 CAP1Q01518 475 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 NCAPG2Q86XI2 1143 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 TEX2Q8IWB9 1127 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 ACAD9Q9H845 621 aa20.33■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 ERCC3P19447 782 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 HSD17B4P51659 736 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 GHRHRQ02643 423 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 FAM110CQ1W6H9 321 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 KRT25Q7Z3Z0 450 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 CHAMP1Q96JM3 812 aa20.32■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 COPB2P35606 906 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 SP3Q02447 781 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 NSMFQ6X4W1 530 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 PGBD1Q96JS3 809 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 PORCNQ9H237 461 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 FBXO40Q9UH90 709 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 FKTNO75072 461 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 CCNA1P78396 465 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 MYSM1Q5VVJ2 828 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 RNF207Q6ZRF8 634 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 SHCBP1Q8NEM2 672 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 MROH8Q9H579 483 aa20.31■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 DOCK3Q8IZD9 2030 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 RPS6P62753 249 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 AP3B2Q13367 1082 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 SLC30A10Q6XR72 485 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 FCHSD1Q86WN1 690 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 SAMD3Q8N6K7 520 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 EFCC1Q9HA90 598 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 A1CFQ9NQ94 594 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 COL20A1Q9P218 1284 aa20.3■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 SPDYE3A6NKU9 549 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 FOSP01100 380 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 CTGFP29279 349 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 MRE11P49959 708 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 MCTP2Q6DN12 878 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 CD99L2Q8TCZ2 262 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 SYTL5Q8TDW5 730 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 ANO3Q9BYT9 981 aa20.29■□□□□ 0.84
CCDC78-201ENST00000293889 ARHGAP39Q9C0H5 1083 aa20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.7 ms