RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000289228.6

ACTR1B-201, Transcript of ARP1 actin related protein 1 homolog B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ACTR1B, Length 2,243 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTR1B-201ENST00000289228 SNED1Q8TER0 1413 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTR1B-201ENST00000289228 BTDP43251 543 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTR1B-201ENST00000289228 NFIXQ14938 502 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTR1B-201ENST00000289228 C16orf86Q6ZW13 317 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTR1B-201ENST00000289228 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP25.27■■□□□ 1.64
ACTR1B-201ENST00000289228 EXOC4Q96A65 974 aa25.27■■□□□ 1.64
ACTR1B-201ENST00000289228 WDR93Q6P2C0 686 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 CCDC170Q8IYT3 715 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 NEDD1Q8NHV4 660 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 VAT1LQ9HCJ6 419 aa25.26■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 EIF3CLB5ME19 914 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 PAPD7Q5XG87 772 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 TBCKQ8TEA7 893 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 CALML4Q96GE6 196 aa25.25■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 AMIGO3Q86WK7 504 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 CERS3Q8IU89 383 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 PSD3Q9NYI0 1048 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 COBLL1Q53SF7 1204 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 FKBP15Q5T1M5 1219 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 TEX11Q8IYF3 940 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 ERGIC2Q96RQ1 377 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 PIGSQ96S52 555 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 MMS19Q96T76 1030 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 VPS18Q9P253 973 aa25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP25.24■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 SRGAP2O75044 1071 aa25.23■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 USP14P54578 494 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 FIGNQ5HY92 759 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 KIAA0895Q8NCT3 520 aa25.23■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 LACRTQ9GZZ8 138 aa25.23■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 A0A1W2PQJ5 194 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 RCCD1A6NED2 376 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 POTEDQ86YR6 584 aa25.22■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 HPS3Q969F9 1004 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 TXKP42681 527 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 SV2BQ7L1I2 683 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 CEP95Q96GE4 821 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 SEMA6BQ9H3T3 888 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 SLC39A2Q9NP94 309 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 CDK5RAP2Q96SN8 1893 aa25.22■■□□□ 1.63
ACTR1B-201ENST00000289228 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa25.21■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 CDK17Q00537 523 aa25.21■■□□□ 1.63
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ACTR1B-201ENST00000289228 CENPPQ6IPU0 288 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 ACBD3Q9H3P7 528 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 ESYT2A0FGR8 921 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 MCM3P25205 808 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 CYP27A1Q02318 531 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 GRB10Q13322 594 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 IQCDQ96DY2 449 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 CD209Q9NNX6 404 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 LRWD1Q9UFC0 647 aa25.2■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 ANO9A1A5B4 782 aa25.19■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 LRRIQ3A6PVS8 624 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 USP17L5A8MUK1 530 aa25.19■■□□□ 1.62
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ACTR1B-201ENST00000289228 RFC4P35249 363 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 VAV2P52735 878 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 KIF5AQ12840 1032 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 HSP90B2PQ58FF3 399 aa25.18■■□□□ 1.62
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ACTR1B-201ENST00000289228 STK17AQ9UEE5 414 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 FAN1Q9Y2M0 1017 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 DUSP10Q9Y6W6 482 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 MYMKA6NI61 221 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 SPA17Q15506 151 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 VWA3BQ502W6 1294 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 MUM1L1Q5H9M0 696 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 UNC13DQ70J99 1090 aa25.18■■□□□ 1.62
ACTR1B-201ENST00000289228 CNBD1Q8NA66 436 aa25.18■■□□□ 1.62
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