RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000281171.8

PTPRO-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type O, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRO, Length 5,301 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRO-201ENST00000281171 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ITGA6P23229 1130 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ITIH3Q06033 890 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 RCN2Q14257 317 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SFMBT2Q5VUG0 894 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KRT25Q7Z3Z0 450 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PPP4R1Q8TF05 950 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NSMCE1Q8WV22 266 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SGSM3Q96HU1 749 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 C10orf88Q9H8K7 445 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PCP11498 1178 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KCNA3P22001 575 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CNNM4Q6P4Q7 775 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PACS2Q86VP3 889 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PLA2G4DQ86XP0 818 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF280CQ8ND82 737 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CARD10Q9BWT7 1032 aa15.63■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MBD4O95243 580 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MMEP08473 750 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TNFAIP3P21580 790 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC15Q0P6D6 951 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PNOCQ13519 176 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GLE1Q53GS7 698 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SGSM2O43147 1006 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SNX16P57768 344 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MRPS15P82914 257 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 COG1Q8WTW3 980 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PDP2Q9P2J9 529 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 EXOC7Q9UPT5 735 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 LZTS1Q9Y250 596 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AP1G2O75843 785 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KLHL30Q0D2K2 578 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 VSTM4Q8IW00 320 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DACT3Q96B18 629 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SH3GL2Q99962 352 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 BTG4Q9NY30 223 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 EPS15L1Q9UBC2 864 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GSTA2P09210 222 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KCNA4P22459 653 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SMTNP53814 917 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 OLFML1Q6UWY5 402 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 C2CD5Q86YS7 1000 aa15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 THAP12O43422 761 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PDE5AO76074 875 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SERPINB4P48594 390 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 INPP1P49441 399 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ZFATQ9P243 1243 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PPP1R37O75864 691 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NCAPH2Q6IBW4 605 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NELFBQ8WX92 580 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PFKFB2O60825 505 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 MCF2P10911 925 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ATP5JP18859 108 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GCKRQ14397 625 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NUGGCQ68CJ6 796 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TMEM60Q9H2L4 133 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PICALMQ13492 652 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 EFHD1Q9BUP0 239 aa15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PFKFB1P16118 471 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DNM2P50570 870 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PANX2Q96RD6 677 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PLAAQ9Y263 795 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CUL1Q13616 776 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 LRGUKQ96M69 825 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CYTH2Q99418 400 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SLC27A2O14975 620 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 GNPATO15228 680 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 BLVRAP53004 296 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 PPP2R2AP63151 447 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CUL4BQ13620 913 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CYB5D1Q6P9G0 228 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TTLL11Q8NHH1 800 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CHMP6Q96FZ7 201 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KDRP35968 1356 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CASP14P31944 242 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 ADCY2Q08462 1091 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SEMA3FQ13275 785 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 SPATA1Q5VX52 437 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 CCDC138Q96M89 665 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 OSBPL5Q9H0X9 879 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 NOD2Q9HC29 1040 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 TRPC6Q9Y210 931 aa15.6■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KCNJ18B7U540 433 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 AP2B1P63010 937 aa15.59■□□□□ 0.09
PTPRO-201ENST00000281171 KCNJ12Q14500 433 aa15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms