RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 JRKLQ9Y4A0 524 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CYTH3O43739 400 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 USP17L8P0C7I0 530 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 PRDX5P30044 214 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 NOP2P46087 812 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ITPK1Q13572 414 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SPA17Q15506 151 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 TXNRD1Q16881 649 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CCDC96Q2M329 555 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 TRIM58Q8NG06 486 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 HDAC7Q8WUI4 952 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 C7orf25Q9BPX7 421 aa16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 STXBP3O00186 592 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 HEATR3Q7Z4Q2 680 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 AMOTL1Q8IY63 956 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 FAM76AQ8TAV0 307 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SH2D4AQ9H788 454 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 EFCC1Q9HA90 598 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MLXIPQ9HAP2 919 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MCM9Q9NXL9 1143 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 A0A0G2JS52 829 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ASIC1P78348 528 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 FKBP15Q5T1M5 1219 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 GALNT17Q6IS24 598 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ANKS1AQ92625 1134 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 LRRC1Q9BTT6 524 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 BARHL2Q9NY43 387 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 PLAGL2Q9UPG8 496 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CASZ1Q86V15 1759 aa16.62■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 TACC1O75410 805 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CCDC70Q6NSX1 233 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 KIAA0895Q8NCT3 520 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 HPS3Q969F9 1004 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 AK8Q96MA6 479 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 TCP11L1Q9NUJ3 509 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6CA6NDK9 693 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 EPHB6O15197 1021 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MOCS3O95396 460 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6DP0CG33 693 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 GNAQP50148 359 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 ITIH3Q06033 890 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 PACS2Q86VP3 889 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 NGLY1Q96IV0 654 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 DRC1Q96MC2 740 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SEMA6BQ9H3T3 888 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa16.61■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 OR52Z1P0C646 297 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 PRLRP16471 622 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SIK1P57059 783 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 DNAJC21Q5F1R6 531 aaKnown RBP16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 C2CD5Q86YS7 1000 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SPATA4Q8NEY3 305 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 DYNLL2Q96FJ2 89 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 USP17L3A6NCW0 530 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 USP17L4A6NCW7 530 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 PPP1R2P41236 205 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 KIF11P52732 1056 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 OSBPL9Q96SU4 736 aa16.6■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 LCA5LO95447 670 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SKIDA1Q1XH10 827 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 VWA3BQ502W6 1294 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 C12orf60Q5U649 245 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 NFRKBQ6P4R8 1299 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 RUBCNQ92622 972 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 IQCDQ96DY2 449 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MTMR7Q9Y216 660 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CCNT1O60563 726 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 EIF4A3P38919 411 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 IRAK1P51617 712 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 LETM2Q2VYF4 491 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 TTC31Q49AM3 519 aaPredicted RBP16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CNNM4Q6P4Q7 775 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SH3GL2Q99962 352 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC39A2Q9NP94 309 aa16.59■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 SLC7A5Q01650 507 aa16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 CENPPQ6IPU0 288 aa16.58■□□□□ 0.25
SYP-201ENST00000263233 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30.8 ms