RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254976.6

SNAP25-201, Transcript of synaptosome associated protein 25, humanhuman

APPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC

Gene SNAP25, Length 2,053 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAP25-201ENST00000254976 WNK4Q96J92 1243 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 SNCAIPQ9Y6H5 919 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF536O15090 1300 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 ACTN4O43707 911 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 PRR29P0C7W0 189 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 NOL9Q5SY16 702 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 C11orf57Q6ZUT1 292 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 CPXCR1Q8N123 301 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 CDCA5Q96FF9 252 aa14.61□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 CFBP00751 764 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 USP14P54578 494 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 MAP3K9P80192 1104 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 FCHSD1Q86WN1 690 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 AFG3L2Q9Y4W6 797 aa14.6□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 LONP1P36776 959 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 TECP42680 631 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 TXKP42681 527 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 LUZP1Q86V48 1076 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 CLMNQ96JQ2 1002 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 MTMR9Q96QG7 549 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 GLT8D2Q9H1C3 349 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 CCPG1Q9ULG6 757 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 CASP1P29466 404 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 PRPHP41219 470 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 KARSQ15046 597 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 CALCRLQ16602 461 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 STAMQ92783 540 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 PLIN2Q99541 437 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.59□□□□□ -0.07
SNAP25-201ENST00000254976 LAD1O00515 517 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 AFMP43652 599 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 STX1AQ16623 288 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ATG4CQ96DT6 458 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ELP3Q9H9T3 547 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 SLC38A10Q9HBR0 1119 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 CBX8Q9HC52 389 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 PCDHA5Q9Y5H7 936 aa14.58□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 SPDYE3A6NKU9 549 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ICAM1P05362 532 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 UBXN2AP68543 259 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ARHGAP4P98171 946 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 AP3B2Q13367 1082 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 E2F4Q16254 413 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 DPCR1Q3MIW9 517 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 PPP4R3AQ6IN85 833 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 CRYGNQ8WXF5 182 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 HAS1Q92839 578 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 HOMER2Q9NSB8 354 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 C19orf81C9J6K1 198 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 PIK3CDO00329 1044 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 NFIBO00712 420 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ALAS1P13196 640 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 POSTNQ15063 836 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 FAM200AQ8TCP9 573 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 LRRC15Q8TF66 581 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 C12orf42Q96LP6 360 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 TUBE1Q9UJT0 475 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 CLEC11AQ9Y240 323 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 CSADQ9Y600 493 aa14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ABCB11O95342 1321 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 SLFN14P0C7P3 912 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 POLR2MP0CAP2 368 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ZNF165P49910 485 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 MUM1L1Q5H9M0 696 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 CLEC4DQ8WXI8 215 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 PAGE5Q96GU1 130 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 IQCA1LA6NCM1 817 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 POTEMA6NI47 508 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 TRAF5O00463 557 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 VWA5AO00534 786 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 AP5Z1O43299 807 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 SREBF1P36956 1147 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 USP11P51784 963 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 PDXDC2PQ6P474 469 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 CYP2W1Q8TAV3 490 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 OTUD5Q96G74 571 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 MTRQ99707 1265 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 ANO10Q9NW15 660 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 TMOD4Q9NZQ9 345 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 USP25Q9UHP3 1055 aa14.56□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 FAM86B1E9PN63 330 aa14.55□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 FOSP01100 380 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
SNAP25-201ENST00000254976 FAM86B2P0C5J1 330 aa14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.3 ms