RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000039517.10

Syde2-201, Transcript of Synapse defective 1, Rho GTPase, homolog 2 (C. elegans), mousemouse

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene Syde2, Length 5,495 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde2-201ENSMUST00000039517 Q9DAQ4 598 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cxcl11Q9JHH5 100 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gdf11Q9Z1W4 405 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Krt78E9Q0F0 1068 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Myo1gQ5SUA5 1024 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Homer2Q9QWW1 354 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Il7P10168 154 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tmed1Q3V009 227 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Slc30a9Q5IRJ6 567 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Elf1Q60775 612 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cep57Q8CEE0 500 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cyp3a57D3YYZ0 503 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zfp94E9Q6Y4 486 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pcdha4O88689 947 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Atp8a1P70704 1164 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 YarsQ91WQ3 528 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tmco4Q91WU4 631 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 MlxiplQ99MZ3 864 aa22.71■■□□□ 1.23
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm28042B7ZCM9 1014 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Axin2O88566 840 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tnnc2P20801 160 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 TxkP42682 527 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 GssP51855 474 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tmem132dQ76HP3 1097 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mei1Q9D4I2 1268 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Plch2A2AP18 1501 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ube4aE9Q735 1028 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 NxnP97346 435 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tcp11Q01755 566 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kif11Q6P9P6 1052 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 B4galnt4Q766D5 1034 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 AsphQ8BSY0 741 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Creb3l3Q91XE9 479 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Apopt1Q9CQW7 192 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Vstm4T1NXB5 319 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sec24cG3X972 1096 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ctnnd1P30999 938 aaKnown RBP22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Sox5P35710 763 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Dach1Q9QYB2 751 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mroh8E9PYI4 1049 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm1661E9Q963 441 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kcnv2Q8CFS6 562 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Arl8aQ8VEH3 186 aa22.7■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ppp1r13bQ62415 1087 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Krt24A1L317 512 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 IkbkgO88522 412 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 FosP01101 380 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ophn1Q99J31 802 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 GdaQ9R111 454 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Arid3aQ62431 601 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Eif4a3Q91VC3 411 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 GsdmeQ9Z2D3 512 aa22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 P4hbP09103 509 aaKnown RBP22.69■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Xbp1O35426 267 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lnx1O70263 728 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 HomezQ80W88 542 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Hps6Q8BLY7 805 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mylk2Q8VCR8 613 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Polr2bQ8CFI7 1174 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Trmt112Q9DCG9 125 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 HnrnpcQ9Z204 313 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gucy2fQ5SDA5 1108 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zfp317Q8C0Q5 607 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Snrnp35Q9D384 244 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rasgrf1P27671 1262 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Stx2Q00262 289 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Rfwd2Q9R1A8 733 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Tex13cD3YU32 604 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 MybP06876 636 aa22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Arid5bQ8BM75 1188 aaKnown RBP22.68■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Usp54Q8BL06 1588 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm7995L7N2E4 160 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 YwhagP61982 247 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ccdc15Q8C9M2 810 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Art2bO35975 289 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Cd72P21855 354 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Q66JV7 365 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Clec16aQ80U30 1036 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Ankrd45Q810N6 248 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Zscan2Q07230 614 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Kmt5aQ2YDW7 349 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Taco1Q8K0Z7 294 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Nr2e3Q9QXZ7 395 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 WaplQ65Z40 1200 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mrps22Q9CXW2 359 aa22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Telo2Q9DC40 840 aaKnown RBP22.67■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Casp14O89094 257 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Atp8b1Q148W0 1251 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Prpf3Q922U1 683 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Mfap3lQ9D3X9 409 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Pacsin2Q9WVE8 486 aaKnown RBP22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Lrrc32G3XA59 663 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm3415J3QMS8 315 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Parp10Q8CIE4 960 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Dhx58Q99J87 678 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Trim42Q9D2H5 723 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Gm3404Q9D506 307 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 Dynll1P63168 89 aa22.66■■□□□ 1.22
Syde2-201ENSMUST00000039517 MpndQ3TV65 487 aa22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 16.8 ms