RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000025354.3

Pggt1b-201, Transcript of Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Pggt1b, Length 2,736 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sp4Q62445 782 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vil1Q62468 827 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc93Q7TQK5 629 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LRWD1Q8BUI3 648 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ces1Q8VCC2 565 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tex13cD3YU32 604 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pagr1bF6V0H0 108 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mdh1P14152 334 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Psmd1Q3TXS7 953 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt74Q6IFZ9 495 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TxlnaQ6PAM1 554 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ccdc57Q6PHN1 1016 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Scfd1Q8BRF7 639 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Yars2Q8BYL4 472 aaKnown RBP14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pagr1aQ99L02 253 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Acot3Q9QYR7 432 aa14.16□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Arhgap4B1AUY3 965 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnaaf5B9EJR8 853 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Exoc3l2D3YUP5 789 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Aco1P28271 889 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Evi5P97366 809 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lrriq3Q14DL3 633 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Plekha7Q3UIL6 1118 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pcdha7Q91Y13 937 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Uap1Q91YN5 522 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 TbcbQ9D1E6 244 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cd274Q9EP73 290 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mrvi1Q9WUX5 899 aaKnown RBP14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bcorl1A2AQH4 1781 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfp853A0A1D5RM95 733 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tpm3-rs7D3Z2H9 248 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rad23aP54726 363 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Stxbp2Q64324 593 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LdhdQ7TNG8 484 aa14.15□□□□□ -0.14
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ep400Q8CHI8 3072 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Epb41l2O70318 988 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Prkg1P0C605 671 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rfc1P35601 1131 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gucy2cQ3UWA6 1072 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Vmn1r209Q5NC97 312 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cnga2Q62398 664 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Snd1Q78PY7 910 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ctdp1Q7TSG2 960 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Map3k11Q80XI6 850 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gpt2Q8BGT5 522 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Caps2Q8BUG5 550 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 SltmQ8CH25 1031 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdrd3Q91W18 743 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt82Q99M74 516 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LpxnQ99N69 386 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Glrx3Q9CQM9 337 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Saal1Q9D2C2 474 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Sgpp1Q9JI99 430 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt1a8D3Z748 530 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ugt1a10E9PXN7 530 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2c68K7N6C2 491 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Gna11P21278 359 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Pola2P33611 600 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Jakmip3Q5DTN8 844 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 FntaQ61239 377 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bbs9Q811G0 885 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Efcab8Q8C9R9 203 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mettl5Q8K1A0 209 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Oxnad1Q8VE38 311 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Txndc5Q91W90 417 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Mis18aQ9CZJ6 204 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cbx8Q9QXV1 362 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Polr2aP08775 1970 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ankrd35E9Q9D8 996 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Krt86P97861 486 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 KhsrpQ3U0V1 748 aaKnown RBP14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hpcal4Q8BGZ1 191 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Anks1bQ8BIZ1 1259 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kbtbd13Q8C828 458 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Bicdl2Q8CHW5 507 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kctd10Q922M3 315 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 4921524L21RikQ9D5T2 438 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lmbr1Q9JIT0 490 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nlrp5Q9R1M5 1163 aa14.14□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Il13ra2O88786 383 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 LbrQ3U9G9 626 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Znhit6Q3UFB2 460 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Fbxo28Q8BIG4 368 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Rasal3Q8C2K5 1041 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Phc3Q8CHP6 981 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Dnai2A2AC93 623 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Palm3A2TJV2 734 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ildr2B5TVM2 661 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Nova2D3YVV7 556 aaKnown RBP14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Zfand4D3Z3C6 739 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Tdo2P48776 406 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Cyp2e1Q05421 493 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Kiaa1468Q148V7 1216 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Hoxa13Q62424 386 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Lman1lQ8VCD3 505 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Ndfip2Q91ZP6 311 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Klhl40Q9D783 621 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Golga5Q9QYE6 729 aa14.13□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 RargP18911 458 aaKnown RBP14.12□□□□□ -0.15
Pggt1b-201ENSMUST00000025354 Q3UJP5 209 aa14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 28.7 ms