RNA–Protein interactions for RNA: YKR061W

KTR2, Transcript of Mannosyltransferase involved in N-linked protein glycosylation, yeast

Gene KTR2, Length 1,278 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
KTR2	YKR061W	YEL057C	P39983	233 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	LRO1	P40345	661 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CAB2	P40506	365 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MET28	P40573	187 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MSS2	P40990	351 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	IAH1	P41734	238 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MNT4	P53745	580 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ESBP6	P53918	673 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NOP15	P53927	220 aa	Predicted RBP	4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	KTR6	P54070	446 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ATG21	Q02887	496 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ABZ2	Q03266	374 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YLR173W	Q06247	608 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ARR2	Q06597	130 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CRD1	Q07560	283 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	AAD4	Q07747	329 aa		4.39	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PRB1	P09232	635 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPL11A	P0C0W9	174 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CDC26	P14724	124 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	DAP2	P18962	818 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ERG6	P25087	383 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SWI4	P25302	1093 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	BUD14	P27637	709 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PTR2	P32901	601 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	OCT1	P35999	772 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MYO3	P36006	1272 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MIA40	P36046	403 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ERC1	P38767	581 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YTA12	P40341	825 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NET1	P47035	1189 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	HXT16	P47185	567 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TOM22	P49334	152 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MNT2	P53059	558 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	COG1	P53079	417 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	HDA1	P53973	706 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPS15	Q01855	142 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CLU1	Q03690	1277 aa	Known RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	VPS20	Q04272	221 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	URC2	Q04411	772 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CRR1	Q05790	422 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NNT1	Q05874	261 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RKM1	Q08961	583 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ULA1	Q12059	462 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	HOS1	Q12214	470 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YJR112W-A	Q3E743	109 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPL11B	Q3E757	174 aa	Predicted RBP	4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	LAG2	Q92325	660 aa		4.38	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RSR1	P13856	272 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ARO3	P14843	370 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CDC23	P16522	626 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PRE10	P21242	288 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.37	□□□□□ -1.71	not detected
KTR2	YKR061W	GID7	P25569	745 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CRM1	P30822	1084 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PRO3	P32263	286 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	AFG1	P32317	509 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NTH1	P32356	751 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NEM1	P38757	446 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SET5	P38890	526 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MAD2	P40958	196 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	DLD2	P46681	530 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ABM1	P47146	123 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	AAD10	P47182	288 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YGL138C	P53122	345 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RMD9	P53140	646 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PRM1	P53835	661 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPM2	Q02773	1202 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPN9	Q04062	393 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SOV1	Q04748	898 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NOP12	Q08208	459 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GPB1	Q08886	897 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ATG29	Q12092	213 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RTK1	Q12100	620 aa	Predicted RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	LEU9	Q12166	604 aa	Known RBP	4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TUS1	Q06412	1307 aa		4.37	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TAO3	P40468	2376 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPS17A	P02407	136 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CDC36	P06100	191 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SAM1	P10659	382 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPS17B	P14127	136 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SAM2	P19358	384 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	PET18	P25362	215 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	GEX1	P25596	615 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SYN8	P31377	255 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	NDI1	P32340	513 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ARP2	P32381	391 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MF(ALPHA)2	P32435	120 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	ATP11	P32453	318 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPT5	P33297	434 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RSM22	P36056	628 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	MAK5	P38112	773 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	UBP13	P38187	747 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TSL1	P38427	1098 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	CRG1	P38892	291 aa	RIP-Chip data	4.36	□□□□□ -1.71	not detected
KTR2	YKR061W	ZRG8	P40021	1076 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	TMN3	P40071	706 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	YER158C	P40095	573 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SLS1	P42900	643 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	RPA34	P47006	233 aa	Predicted RBP	4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	SMC3	P47037	1230 aa		4.36	□□□□□ -1.71
KTR2	YKR061W	APT1	P49435	187 aa	Known RBP	4.36	□□□□□ -1.71

Retrieved 100 of 5,963 RNA–protein pairs in 19.7 ms