RNA–Protein interactions for RNA: YGR088W

CTT1, Transcript of Cytosolic catalase T, yeast

Gene CTT1, Length 1,689 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
CTT1	YGR088W	FIS1	P40515	155 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	FMP32	P43557	207 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	FAR3	P46671	204 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YJR054W	P47114	497 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	JJJ3	P47138	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YJR120W	P47157	116 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RFX1	P48743	811 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YTP1	P53584	459 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ASI2	P53895	289 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ARP4	P80428	489 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RLI1	Q03195	608 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HER2	Q03557	464 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YDR239C	Q03780	787 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TVP15	Q03860	143 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RAD30	Q04049	632 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	COQ9	Q05779	260 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	THI7	Q05998	598 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YLR345W	Q06137	509 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	THI72	Q08579	599 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RBD2	Q12270	262 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MDM12	Q92328	271 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YCL001W-B	Q96VH2	84 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPS9A	O13516	197 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SEM1	O94742	89 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CDC19	P00549	500 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PMA1	P05030	918 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RPS9B	P05755	195 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CBP6	P07253	162 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	STE12	P13574	688 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PDX1	P16451	410 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CDC42	P19073	191 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	COX11	P19516	300 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SNT1	P25357	1226 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SED4	P25365	1065 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DBF20	P32328	564 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TMT1	P32643	299 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MKS1	P34072	584 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PIN4	P34217	668 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
CTT1	YGR088W	MRPL37	P36532	105 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MCM7	P38132	845 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CST26	P38226	397 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GIP1	P38229	639 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PFF1	P38244	976 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TOS1	P38288	455 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SAH1	P39954	449 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SPF1	P39986	1215 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PEP8	P40335	379 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GSM1	P42950	618 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	IRC6	P43615	237 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ARC1	P46672	376 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CPR7	P47103	393 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	IMD3	P50095	523 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	LYS5	P50113	272 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RMR1	P53060	241 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RCF2	P53721	224 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TEP1	P53916	434 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SLU7	Q02775	382 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	EAR1	Q03212	550 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YMR010W	Q03687	405 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ISR1	Q06098	443 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YPR091C	Q06833	770 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	IWR1	Q07532	353 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YLL007C	Q07799	665 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SMC5	Q08204	1093 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MCH5	Q08777	521 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DDC1	Q08949	612 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RRG1	Q12167	365 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TY3A-G	Q12173	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GRX6	Q12438	231 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SKS1	Q12505	502 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HSH49	Q99181	213 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TY3A-I	Q99219	290 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CAR2	P07991	424 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	IMA3	P0CW40	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	IMA4	P0CW41	589 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	CLN2	P20438	545 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SEC62	P21825	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SAN1	P22470	610 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	MIH1	P23748	554 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	VMA16	P23968	213 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	YCR101C	P25607	182 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PET309	P32522	965 aa	Predicted RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SPR1	P32603	445 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TIM23	P32897	222 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GLG1	P36143	616 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RRP3	P38712	501 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GIP4	P39732	760 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	DDI1	P40087	428 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	SCC4	P40090	624 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	HPM1	P40481	377 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	INP51	P40559	946 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	ELP2	P42935	788 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	GTO1	P48239	356 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RTA1	P53047	317 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	LCL3	P53153	274 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	TAM41	P53230	385 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	RBG2	P53295	368 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	NRD1	P53617	575 aa	Known RBP RIP-Chip data	4.54	□□□□□ -1.68	not detected
CTT1	YGR088W	MPS1	P54199	764 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTT1	YGR088W	PEX25	Q02969	394 aa		4.54	□□□□□ -1.68

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