RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000639501.1

PMS1-222, Transcript of PMS1 homolog 1, mismatch repair system component, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PMS1, Length 2,506 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS1-222ENST00000639501 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CCDC170Q8IYT3 715 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 LRRC15Q8TF66 581 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PLIN2Q99541 437 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 MTA3Q9BTC8 594 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ARAP2Q8WZ64 1704 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 TNS2Q63HR2 1409 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa22.85■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 NCK2O43639 380 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 EPHB4P54760 987 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 OSBPL9Q96SU4 736 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 OPA1O60313 960 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ZBED6P86452 979 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 CXorf56Q9H5V9 222 aa22.84■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 APBA1Q02410 837 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 TROAPQ12815 778 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ESR2Q92731 530 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 SH2D4AQ9H788 454 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 STIM2Q9P246 746 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ERVV-2B6SEH9 535 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 HSPA1LP34931 641 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 IFIT1BQ5T764 474 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 DISC1Q9NRI5 854 aa22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
PMS1-222ENST00000639501 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ZEB2O60315 1214 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 GNAT2P19087 354 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TMTC3Q6ZXV5 915 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 DNAJC10Q8IXB1 793 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 C4orf32Q8N8J7 132 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TRIM58Q8NG06 486 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 HSF2BPO75031 334 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 MIIPQ5JXC2 388 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CSGALNACT2Q8N6G5 542 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RUFY1Q96T51 708 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 SALL4Q9UJQ4 1053 aa22.82■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 EPHB6O15197 1021 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 FAM153BP0C7A2 387 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 GUCY1A3Q02108 690 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 EVX2Q03828 476 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NNTQ13423 1086 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 FAM153CQ494X1 144 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TYW1BQ6NUM6 668 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 EMBQ6PCB8 327 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CATIPQ7Z7H3 387 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 IFIH1Q9BYX4 1025 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ARHGAP20Q9P2F6 1191 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 FAM153AQ9UHL3 310 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 DUOX1Q9NRD9 1551 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 FAM205AQ6ZU69 1335 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 BAZ2AQ9UIF9 1905 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 BCAMP50895 628 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ITIH3Q06033 890 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CAVIN3Q969G5 261 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CNOT6LQ96LI5 555 aaKnown RBP22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CCDC42Q96M95 316 aa22.81■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ESYT3A0FGR9 886 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 PSMA7O14818 248 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TACC1O75410 805 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 MAP2K2P36507 400 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NLRP5P59047 1200 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 PPP2R5BQ15173 497 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 PCDHA13Q9Y5I0 950 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 LRP5O75197 1615 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ZNF233A6NK53 670 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 MEFVO15553 781 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ALS2CLQ60I27 953 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 GIMAP8Q8ND71 665 aaPredicted RBP22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RASGRP4Q8TDF6 673 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 MS4A14Q96JA4 679 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TSGA10Q9BZW7 698 aa22.8■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 FSBPO95073 299 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 LSP1P33241 339 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 SPA17Q15506 151 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NAA35Q5VZE5 725 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 OTUD6BQ8N6M0 293 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ATXN2Q99700 1313 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 NMT2O60551 498 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 SLC5A1P13866 664 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 LONP1P36776 959 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CARSP49589 748 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 RUBCNQ92622 972 aa22.79■■□□□ 1.24
PMS1-222ENST00000639501 CABS1Q96KC9 395 aa22.79■■□□□ 1.24
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