RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637175.1

ATRX-223, Transcript of ATRX, chromatin remodeler, human

TSL 5

Gene ATRX, Length 100 nt, Biotype processed transcript.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ATRX-223	ENST00000637175	HSD3B2	P26439	372 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SUMO1	P63165	101 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	NTRK3	Q16288	839 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PRSS53	Q2L4Q9	553 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	EGFLAM	Q63HQ2	1017 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	EEF1DP3	Q658K8	133 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SLC23A3	Q6PIS1	610 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	C16orf86	Q6ZW13	317 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	KIAA0907	Q7Z7F0	614 aa	Predicted RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	HOMER1	Q86YM7	354 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SYNPO	Q8N3V7	929 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM52	Q8NDY8	209 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	KCTD13	Q8WZ19	329 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PTCHD1	Q96NR3	888 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ALPK1	Q96QP1	1244 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	EBF1	Q9UH73	591 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	NPFFR2	Q9Y5X5	522 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SHROOM4	Q9ULL8	1493 aa		4.6	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	WNT11	O96014	354 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	L1CAM	P32004	1257 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TRIM61	Q5EBN2	209 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	E4F1	Q66K89	784 aa	Predicted RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CYP2R1	Q6VVX0	501 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	KSR1	Q8IVT5	923 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	AGBL5	Q8NDL9	886 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	MAP6	Q96JE9	813 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	MMP19	Q99542	508 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CDC6	Q99741	560 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CDADC1	Q9BWV3	514 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	NCOA5	Q9HCD5	579 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	PCMTD2	Q9NV79	361 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	C19orf73	Q9NVV2	129 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	SLAMF8	Q9P0V8	285 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		4.59	□□□□□ -1.67
ATRX-223	ENST00000637175	FADS2P1	A8MWK0	482 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PLD2	O14939	933 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	KCNQ2	O43526	872 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RFPL3	O75679	317 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PLS3	P13797	630 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RPL10	P27635	214 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ECI1	P42126	302 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	KIR2DL1	P43626	348 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	KIR2DL2	P43627	348 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	KCNJ6	P48051	423 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SEPHS1	P49903	392 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TCEA2	Q15560	299 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TKFC	Q3LXA3	575 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ARTN	Q5T4W7	220 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC103	Q8IW40	242 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	HHIPL1	Q96JK4	782 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	MRPL4	Q9BYD3	311 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SP110	Q9HB58	689 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GPRC5C	Q9NQ84	441 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PRDM7	Q9NQW5	492 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	MBNL3	Q9NUK0	354 aa	Known RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CLEC1B	Q9P126	229 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TNFRSF10D	Q9UBN6	386 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ADAMTS6	Q9UKP5	1117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TRBV23OR9-2	A0A075B6M9	112 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PPP1R12A	O14974	1030 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	MEFV	O15553	781 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ASMTL	O95671	621 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PAM	P19021	973 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	DUSP4	Q13115	394 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	KCNAB2	Q13303	367 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	FNDC3B	Q53EP0	1204 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	MBLAC2	Q68D91	279 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	STYK1	Q6J9G0	422 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RSPO2	Q6UXX9	243 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	SLCO6A1	Q86UG4	719 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PPIL6	Q8IXY8	311 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ANKS4B	Q8N8V4	417 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GSTCD	Q8NEC7	633 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	DCAF4	Q8WV16	495 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CCDC120	Q96HB5	630 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	IPO9	Q96P70	1041 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	FEZ1	Q99689	392 aa		4.57	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	ASXL2	Q76L83	1435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PQ45	241 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175		A0A1W2PQY0	241 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	BLACE	A4D250	179 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NOTO	A8MTQ0	251 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	USP2	O75604	605 aa	Predicted RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	TBC1D8	O95759	1140 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	HPX	P02790	462 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	RNASE1	P07998	156 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	CANX	P27824	592 aa	Known RBP	4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	LTBR	P36941	435 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GDNF	P39905	211 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	GABRE	P78334	506 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	PLCL1	Q15111	1095 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	NR0B2	Q15466	257 aa		4.56	□□□□□ -1.68
ATRX-223	ENST00000637175	INF2	Q27J81	1249 aa		4.56	□□□□□ -1.68

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