RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000615007.4

LYNX1-208, Transcript of Ly6/neurotoxin 1, human

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LYNX1, Length 1,293 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LYNX1-208	ENST00000615007	MUM1L1	Q5H9M0	696 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LYNX1-208	ENST00000615007	NSMF	Q6X4W1	530 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LYNX1-208	ENST00000615007	DGKH	Q86XP1	1220 aa		31.77	■■■□□ 2.68
LYNX1-208	ENST00000615007	SOWAHB	A6NEL2	793 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	CLTB	P09497	229 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	GJA9	P57773	515 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	ZNF543	Q08ER8	600 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	KCNA10	Q16322	511 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	KATNBL1	Q9H079	304 aa		31.76	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	31.76	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	SNHG28	P0DPA3	235 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	GLT1D1	Q96MS3	346 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	LCT	P09848	1927 aa		31.75	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	31.74	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	ELP1	O95163	1332 aa		31.74	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		31.74	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	PQBP1	O60828	265 aa	Known RBP	31.73	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	KDM4A	O75164	1064 aa		31.73	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	TNFAIP2	Q03169	654 aa		31.73	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	TOX2	Q96NM4	488 aa		31.73	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	LOC102724159	A0A0B4J2E5	919 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	ADCY6	O43306	1168 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	PWP2	Q15269	919 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	NOL8	Q76FK4	1167 aa	Known RBP	31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	BAD	Q92934	168 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	ZKSCAN3	Q9BRR0	538 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	KRT23	Q9C075	422 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	WDR19	Q8NEZ3	1342 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	RAD50	Q92878	1312 aa		31.72	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	MYADML2	A6NDP7	307 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	ASGR1	P07306	291 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	GNAS	Q5JWF2	1037 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	TTC22	Q5TAA0	569 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	SH3RF1	Q7Z6J0	888 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	KAT14	Q9H8E8	782 aa		31.71	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM43B	A6NCK2	446 aa		31.7	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	NKX3-2	P78367	333 aa		31.7	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	PNMA1	Q8ND90	353 aa		31.7	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	31.7	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	VTA1	Q9NP79	307 aa		31.7	■■■□□ 2.67
LYNX1-208	ENST00000615007	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007		B4E1Z4	1266 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	KIAA0355	O15063	1070 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	RAG1	P15918	1043 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	DEFB123	Q8N688	67 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	MORC4	Q8TE76	937 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	RUFY2	Q8WXA3	655 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ASTN1	O14525	1302 aa		31.69	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	NFIB	O00712	420 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	PDE4A	P27815	886 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	31.68	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	TLK2	Q86UE8	772 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		31.68	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	31.67	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		31.67	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ANKS1A	Q92625	1134 aa		31.67	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		31.67	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	31.67	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007		Q9Y3F1	56 aa		31.67	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ZEB2	O60315	1214 aa		31.66	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	GSPT1	P15170	499 aa	Known RBP	31.66	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	31.66	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	TNKS	O95271	1327 aa		31.66	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	CABYR	O75952	493 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	FAAP100	Q0VG06	881 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ASPRV1	Q53RT3	343 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ENAH	Q8N8S7	591 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	ZSWIM5	Q9P217	1185 aa		31.65	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		31.64	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		31.64	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		31.64	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007	MYH6	P13533	1939 aa		31.64	■■■□□ 2.66
LYNX1-208	ENST00000615007		B4DLN1	442 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	ARVCF	O00192	962 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	CTAGE5	O15320	804 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	SMPD1	P17405	629 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	CALML3	P27482	149 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	MRPL12	P52815	198 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	SHH	Q15465	462 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	MAF1	Q9H063	256 aa		31.63	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	31.62	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	CDK7	P50613	346 aa		31.62	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	31.62	■■■□□ 2.65
LYNX1-208	ENST00000615007	BEX3	Q00994	111 aa		31.62	■■■□□ 2.65

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