RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588815.5

CAPNS1-206, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CAPNS1, Length 1,471 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBED4O75132 1171 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CLK2P49760 499 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAP25P60880 206 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 EARS2Q5JPH6 523 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP35.48■■■■□ 3.271e-7■■■□□ 14.8
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXC10Q9NYD6 342 aa35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 MRPL11Q9Y3B7 192 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP35.48■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 DSG3P32926 999 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 KLHL40Q2TBA0 621 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 USH1GQ495M9 461 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP35.47■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A0G2JMZ2 1700 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 SPTLC2O15270 562 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 PPP6R2O75170 966 aa35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP35.46■■■■□ 3.275e-6■■■■□ 22.9
CAPNS1-206ENST00000588815 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP35.46■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 ADAMTS3O15072 1205 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 OAZ1P54368 228 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 PTPAQ15257 358 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 CCDC174Q6PII3 467 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 RASGRP4Q8TDF6 673 aa35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP35.45■■■■□ 3.27
CAPNS1-206ENST00000588815 FAM205CA6NFA0 338 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 AP3B2Q13367 1082 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 TTC38Q5R3I4 469 aa35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ZNF536O15090 1300 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 PIK3CDO00329 1044 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 VWA5AO00534 786 aa35.43■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP35.42■■■■□ 3.263e-8■■□□□ 13.7
CAPNS1-206ENST00000588815 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 SNAPC2Q13487 334 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 SAMD3Q8N6K7 520 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 CCPG1Q9ULG6 757 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHB6Q9Y5E3 794 aa35.42■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 FOSP01100 380 aaPredicted RBP35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 GADL1Q6ZQY3 521 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP2A1O14983 1001 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ME1P48163 572 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ATG4CQ96DT6 458 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ANP32EQ9BTT0 268 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 AGTPBP1Q9UPW5 1226 aa35.41■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 MEIS2O14770 477 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ADALQ6DHV7 355 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 NEK8Q86SG6 692 aa35.4■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 INF2Q27J81 1249 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 WNK4Q96J92 1243 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 PGBD1Q96JS3 809 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 MAF1Q9H063 256 aa35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP35.39■■■■□ 3.26
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP2B1P20020 1258 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 TREML2Q5T2D2 321 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 CST9Q5W186 159 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 MB21D1Q8N884 522 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 REPS2Q8NFH8 660 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 GPT2Q8TD30 523 aa35.38■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 OPLAHO14841 1288 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 UBE2SQ16763 222 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 LBX2Q6XYB7 198 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 MCF2L2Q86YR7 1114 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 TBCKQ8TEA7 893 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 AGBL1Q96MI9 1066 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 TMEM260Q9NX78 707 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 PCDHA7Q9UN72 937 aa35.37■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQ27 194 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQ64 194 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 A0A1W2PQD8 194 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 GJA5P36382 358 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 GHRHRQ02643 423 aa35.36■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 GTF2A2P52657 109 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 MOGSQ13724 837 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 USP17L6PQ6QN14 398 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 CPXCR1Q8N123 301 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 RAVER2Q9HCJ3 691 aaKnown RBP35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 SPDYE3A6NKU9 549 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 LAD1O00515 517 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 POLR2MP0CAP2 368 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 IRX3P78415 501 aaPredicted RBP35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 TKFCQ3LXA3 575 aa35.35■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 PASKQ96RG2 1323 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 CUTAO60888 179 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 CETPP11597 493 aa35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP35.34■■■■□ 3.25
CAPNS1-206ENST00000588815 ANO3Q9BYT9 981 aa35.34■■■■□ 3.25
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