RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000574234.1

TRIM25-208, Transcript of tripartite motif containing 25, humanhuman

TSL 2

Gene TRIM25, Length 471 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25-208ENST00000574234 TRIM75PA6NK02 468 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 IGKV5-2P06315 115 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 HIBADHP31937 336 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 TLE2Q04725 743 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 GRIK5Q16478 980 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 GJC2Q5T442 439 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MFSD14CQ5VZR4 134 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ALG1LQ6GMV1 187 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MYO19Q96H55 970 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 UIMC1Q96RL1 719 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ASCC2Q9H1I8 757 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ETNK1Q9HBU6 452 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 CD320Q9NPF0 282 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 EPB41L3Q9Y2J2 1087 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 BAHCC1Q9P281 2608 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF521Q96K83 1311 aa6.47□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 FOCADQ5VW36 1801 aa6.46□□□□□ -1.37
TRIM25-208ENST00000574234 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 POTEB3A0JP26 581 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GRXCR1A8MXD5 290 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 H7C1W4 665 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 HOXC6P09630 235 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 PPP2R1AP30153 589 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 UBE4AQ14139 1066 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 FAM26DQ5JW98 314 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 TMEM240Q5SV17 173 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 MFSD5Q6N075 450 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 PSRC1Q6PGN9 363 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 POTEBQ6S5H4 581 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GPR142Q7Z601 462 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GJD3Q8N144 294 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 MARVELD3Q96A59 401 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 TOX2Q96NM4 488 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 PRRX2Q99811 253 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 LRFN2Q9ULH4 789 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 MTCH2Q9Y6C9 303 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 SIPA1L1O43166 1804 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 SIP14410 1827 aa6.46□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 PTPRSQ13332 1948 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 TIMP1P01033 207 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 CYBAP13498 195 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 SLC5A1P13866 664 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 CNGA1P29973 690 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GNA15P30679 374 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 ADCYAP1R1P41586 468 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GYG1P46976 350 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 PTPN5P54829 565 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 RIPK4P57078 832 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 RBL2Q08999 1139 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 NEXNQ0ZGT2 675 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 TCP10Q12799 353 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 NFIAQ12857 509 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 PPIGQ13427 754 aaKnown RBP eCLIP6.45□□□□□ -1.382e-12■■□□□ 13.3
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TRIM25-208ENST00000574234 CCDC144BQ3MJ40 725 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 TBCELQ5QJ74 424 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF662Q6ZS27 426 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.45□□□□□ -1.38
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TRIM25-208ENST00000574234 FAM178BQ8IXR5 827 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 MICALL1Q8N3F8 863 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 SLC44A5Q8NCS7 719 aa6.45□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 ZNF280CQ8ND82 737 aa6.45□□□□□ -1.38
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TRIM25-208ENST00000574234 FLRT1Q9NZU1 646 aa6.45□□□□□ -1.38
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TRIM25-208ENST00000574234 A6NJY4 79 aa6.44□□□□□ -1.38
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TRIM25-208ENST00000574234 CASP7P55210 303 aa6.44□□□□□ -1.38
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TRIM25-208ENST00000574234 ERVK-24P63145 666 aa6.44□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 FAAP100Q0VG06 881 aa6.44□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 IFIT5Q13325 482 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 GCKRQ14397 625 aa6.44□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 DUSP27Q5VZP5 1158 aa6.44□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa6.44□□□□□ -1.38
TRIM25-208ENST00000574234 KSR2Q6VAB6 950 aa6.44□□□□□ -1.38
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