RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564966.5

PPP4C-208, Transcript of protein phosphatase 4 catalytic subunit, human

TSL 2

Gene PPP4C, Length 1,122 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PPP4C-208	ENST00000564966	TRIM43	Q96BQ3	446 aa	Predicted RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	RANBP17	Q9H2T7	1088 aa	Known RBP	29.8	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	LTBP2	Q14767	1821 aa		29.8	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	NEDD4	P46934	1319 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	DCDC2C	A8MYV0	355 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	ADCY6	O43306	1168 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	IRX5	P78411	483 aa	Predicted RBP	29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	TNFAIP2	Q03169	654 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC14	Q96N46	770 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	TMEM39A	Q9NV64	488 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	CYP39A1	Q9NYL5	469 aa		29.79	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	PDHB	P11177	359 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	RAG1	P15918	1043 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	EEPD1	Q7L9B9	569 aa		29.78	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	29.78	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	PTPDC1	A2A3K4	754 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	ASGR1	P07306	291 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	BTNL9	Q6UXG8	535 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	IQCA1	Q86XH1	822 aa		29.77	■■■□□ 2.36
PPP4C-208	ENST00000564966	KDM4A	O75164	1064 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	GJA9	P57773	515 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	29.76	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	SHH	Q15465	462 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	AP5M1	Q9H0R1	490 aa		29.76	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	CST5	P28325	142 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	BEX3	Q00994	111 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF543	Q08ER8	600 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	BAAT	Q14032	418 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	IMMT	Q16891	758 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	FBXO16	Q8IX29	292 aa	Predicted RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	PURB	Q96QR8	312 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	KATNBL1	Q9H079	304 aa		29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	UPF3A	Q9H1J1	476 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	ADD3	Q9UEY8	706 aa	Known RBP	29.75	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	GOLGA8H	P0CJ92	632 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	C9orf50	Q5SZB4	431 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	CCSAP	Q6IQ19	270 aa	Predicted RBP	29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	KAT14	Q9H8E8	782 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		29.74	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	ELP1	O95163	1332 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966		B4E1Z4	1266 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	NFIB	O00712	420 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	CALML3	P27482	149 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	CCDC178	Q5BJE1	867 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	TLK2	Q86UE8	772 aa		29.73	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	MROH7	Q68CQ1	1323 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966		A0A0U1RQG5	324 aa	Predicted RBP	29.72	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	ANKRD33	Q7Z3H0	272 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	TOX2	Q96NM4	488 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	DSCC1	Q9BVC3	393 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	PDGFC	Q9NRA1	345 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	PNMA2	Q9UL42	364 aa		29.72	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	ASTN1	O14525	1302 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA0355	O15063	1070 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	DYNC1LI2	O43237	492 aa	Predicted RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	ITGB8	P26012	769 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	FAAP100	Q0VG06	881 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	GPATCH4	Q5T3I0	446 aa	Known RBP	29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	KIAA1211	Q6ZU35	1233 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	DGKH	Q86XP1	1220 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	PNMA1	Q8ND90	353 aa		29.71	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	SMPD1	P17405	629 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	FPGS	Q05932	587 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	USH1G	Q495M9	461 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	RNF207	Q6ZRF8	634 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	FAM161B	Q96MY7	647 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	ZSCAN10	Q96SZ4	725 aa	Predicted RBP	29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	UBA5	Q9GZZ9	404 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	VTA1	Q9NP79	307 aa		29.7	■■■□□ 2.35
PPP4C-208	ENST00000564966	LAMA4	Q16363	1823 aa		29.7	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	ZEB2	O60315	1214 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	ALDH5A1	P51649	535 aa	Predicted RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	FSCN1	Q16658	493 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	IQSEC1	Q6DN90	963 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC30A10	Q6XR72	485 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	MPHOSPH6	Q99547	160 aa	Known RBP	29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	UBAC1	Q9BSL1	405 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	KRT23	Q9C075	422 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	CPVL	Q9H3G5	476 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	MTMR10	Q9NXD2	777 aa		29.69	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	ARVCF	O00192	962 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	TLR3	O15455	904 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	SNHG28	P0DPA3	235 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	PTGS1	P23219	599 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	NT5C2	P49902	561 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	TTC22	Q5TAA0	569 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	CXCL17	Q6UXB2	119 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	SLC17A8	Q8NDX2	589 aa		29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	RNPC3	Q96LT9	517 aa	Known RBP	29.68	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE4A	P27815	886 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	ZNF697	Q5TEC3	545 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	CNNM2	Q9H8M5	875 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	GNE	Q9Y223	722 aa	Known RBP	29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	TNKS	O95271	1327 aa		29.67	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	LRRC37A2	A6NM11	1700 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	PDE4D	Q08499	809 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	TAPT1	Q6NXT6	567 aa		29.66	■■■□□ 2.34
PPP4C-208	ENST00000564966	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		29.66	■■■□□ 2.34

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