RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557172.5

KLC1-223, Transcript of kinesin light chain 1, human

TSL 4

Gene KLC1, Length 540 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
KLC1-223	ENST00000557172	TEX2	Q8IWB9	1127 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	DIS3L2	Q8IYB7	885 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	REM2	Q8IYK8	340 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	BLID	Q8IZY5	108 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	CPXCR1	Q8N123	301 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	BICD2	Q8TD16	824 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	GTF3C2	Q8WUA4	911 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	SHISA4	Q96DD7	197 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	AGBL1	Q96MI9	1066 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	FOXP1	Q9H334	677 aa	Predicted RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	PSTPIP2	Q9H939	334 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		11.24	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	DOCK1	Q14185	1865 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	RASSF10	A6NK89	507 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	U2AF2	P26368	475 aa	Known RBP eCLIP	11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	STAT3	P40763	770 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	ADCY7	P51828	1080 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	KIF23	Q02241	960 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	SREBF2	Q12772	1141 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	TMEM132B	Q14DG7	1078 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	TKFC	Q3LXA3	575 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	DAGLB	Q8NCG7	672 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	REPS2	Q8NFH8	660 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	CUL5	Q93034	780 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	PTPN18	Q99952	460 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	RIC8A	Q9NPQ8	531 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	RABGAP1	Q9Y3P9	1069 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF536	O15090	1300 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	ABCB11	O95342	1321 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	MYH8	P13535	1937 aa		11.23	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	ALAS1	P13196	640 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	TM4SF4	P48230	202 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	GCLC	P48506	637 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	REST	Q13127	1097 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	NOG	Q13253	232 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	PLS1	Q14651	629 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	NPY5R	Q15761	445 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	MCTP2	Q6DN12	878 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	CYP4F22	Q6NT55	531 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	BRAP	Q7Z569	592 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	NOSTRIN	Q8IVI9	506 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	FAM43A	Q8N2R8	423 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	SAMD3	Q8N6K7	520 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	OXER1	Q8TDS5	423 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	TNPO1	Q92973	898 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	TRERF1	Q96PN7	1200 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	TEX13B	Q9BXU2	312 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	ZCCHC17	Q9NP64	241 aa	Known RBP	11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	RBPJL	Q9UBG7	517 aa		11.22	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	KIF28P	B7ZC32	967 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	GCOM1	H8Y6P7	765 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	POLR2M	P0CAP2	368 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	CYP2C8	P10632	490 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	GRM1	Q13255	1194 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	NR5A1	Q13285	461 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	SNRNP48	Q6IEG0	339 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	POTEE	Q6S8J3	1075 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	KRT25	Q7Z3Z0	450 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	IFNL1	Q8IU54	200 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	CAPNS2	Q96L46	248 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	PARK7	Q99497	189 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	MAF1	Q9H063	256 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	BTBD7	Q9P203	1132 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	BIN2	Q9UBW5	565 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF214	Q9UL59	606 aa	Predicted RBP	11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	PCDHA6	Q9UN73	950 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	PCDHA8	Q9Y5H6	950 aa		11.21	□□□□□ -0.61
KLC1-223	ENST00000557172	CCDC194	A0A1B0GVG4	234 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172		M0R2N6	131 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	PIK3CD	O00329	1044 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	SLC25A27	O95847	323 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	FOS	P01100	380 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	COPB2	P35606	906 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	FOXD4L6	Q3SYB3	417 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	ATL3	Q6DD88	541 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	USP17L6P	Q6QN14	398 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	FOXD4L3	Q6VB84	417 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	RIOX2	Q8IUF8	465 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	TNS4	Q8IZW8	715 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	REXO1	Q8N1G1	1221 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	CHST13	Q8NET6	341 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	GPRC5A	Q8NFJ5	357 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	CLEC4D	Q8WXI8	215 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	TNFRSF25	Q93038	417 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	ZNF396	Q96N95	335 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	PAGR1	Q9BTK6	254 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	SPATC1L	Q9H0A9	340 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	MAP3K20	Q9NYL2	800 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	RIPK3	Q9Y572	518 aa		11.2	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	IGF2BP3	O00425	579 aa	Known RBP eCLIP	11.19	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	MEIS2	O14770	477 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	OPLAH	O14841	1288 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	ADAMTS3	O15072	1205 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	CNMD	O75829	334 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	ALDH1A1	P00352	501 aa		11.19	□□□□□ -0.62
KLC1-223	ENST00000557172	CFB	P00751	764 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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