RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557115.5

CIPC-208, Transcript of CLOCK interacting pacemaker, humanhuman

TSL 4

Gene CIPC, Length 882 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CIPC-208ENST00000557115 DSCC1Q9BVC3 393 aa25.52■■□□□ 1.68
CIPC-208ENST00000557115 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.52■■□□□ 1.68
CIPC-208ENST00000557115 SZT2Q5T011 3432 aa25.51■■□□□ 1.68
CIPC-208ENST00000557115 TRIM43BA6NCK2 446 aa25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 MYADML2A6NDP7 307 aa25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 TNFAIP2Q03169 654 aa25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 ZNF543Q08ER8 600 aa25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 CCDC178Q5BJE1 867 aa25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 GNASQ5JWF2 1037 aa25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 DEFB123Q8N688 67 aa25.51■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 TRIM43Q96BQ3 446 aaPredicted RBP25.51■■□□□ 1.67
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CIPC-208ENST00000557115 PTPDC1A2A3K4 754 aa25.5■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 DCDC2CA8MYV0 355 aa25.5■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 ADCY6O43306 1168 aa25.5■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 KDM4AO75164 1064 aa25.5■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 CST5P28325 142 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
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CIPC-208ENST00000557115 GJA9P57773 515 aa25.5■■□□□ 1.67
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CIPC-208ENST00000557115 IRX5P78411 483 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 CCSAPQ6IQ19 270 aaPredicted RBP25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 EEPD1Q7L9B9 569 aa25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 KATNBL1Q9H079 304 aa25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 UPF3AQ9H1J1 476 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 KAT14Q9H8E8 782 aa25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 TMEM39AQ9NV64 488 aa25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 LAMA3Q16787 3333 aa25.49■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 C11orf97A0A1B0GVM6 126 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 B4E1Z4 1266 aa25.48■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 RAG1P15918 1043 aa25.48■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP25.48■■□□□ 1.67
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CIPC-208ENST00000557115 ELP1O95163 1332 aa25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 NFIBO00712 420 aa25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 GOLGA8HP0CJ92 632 aa25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 Q7L0L9 218 aa25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 TOX2Q96NM4 488 aa25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 PURBQ96QR8 312 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 KRT23Q9C075 422 aa25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 AP5M1Q9H0R1 490 aa25.47■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.47■■□□□ 1.67
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CIPC-208ENST00000557115 CALML3P27482 149 aa25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 PDE4AP27815 886 aa25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 SHHQ15465 462 aa25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 TTC22Q5TAA0 569 aa25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 ANKRD33Q7Z3H0 272 aa25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 TLK2Q86UE8 772 aa25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 PNMA1Q8ND90 353 aa25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP25.46■■□□□ 1.67
CIPC-208ENST00000557115 ASTN1O14525 1302 aa25.45■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 MROH7Q68CQ1 1323 aa25.45■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 BEX3Q00994 111 aa25.45■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 FAAP100Q0VG06 881 aa25.45■■□□□ 1.66
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CIPC-208ENST00000557115 UBA5Q9GZZ9 404 aa25.45■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CNNM2Q9H8M5 875 aa25.45■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 PDGFCQ9NRA1 345 aa25.45■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 ZSWIM5Q9P217 1185 aa25.45■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 KIAA0355O15063 1070 aa25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 DYNC1LI2O43237 492 aaPredicted RBP25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 ZEB2O60315 1214 aa25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 RUFY2Q8WXA3 655 aa25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 VTA1Q9NP79 307 aa25.44■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
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CIPC-208ENST00000557115 ITGB8P26012 769 aa25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 ALDH5A1P51649 535 aaPredicted RBP25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 FSCN1Q16658 493 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 USH1GQ495M9 461 aa25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 C9orf50Q5SZB4 431 aa25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CLEC4DQ8WXI8 215 aa25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 MPHOSPH6Q99547 160 aaKnown RBP25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 MCM3APO60318 1980 aa25.43■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 TNKSO95271 1327 aa25.42■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.42■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 ARVCFO00192 962 aa25.42■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.42■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 TAPT1Q6NXT6 567 aa25.42■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 SLC30A10Q6XR72 485 aa25.42■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CPVLQ9H3G5 476 aa25.42■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CTAGE5O15320 804 aa25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 TLR3O15455 904 aaKnown RBP25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 NKX3-2P78367 333 aa25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 FPGSQ05932 587 aa25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 CXCL17Q6UXB2 119 aa25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 MORC4Q8TE76 937 aa25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 ANKS1AQ92625 1134 aa25.41■■□□□ 1.66
CIPC-208ENST00000557115 IL25Q9H293 177 aa25.41■■□□□ 1.66
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